mirna与转录后调控.pptVIP

转录后调控 ——microRNA的研究进展 ;Outlines; ;转 录 transcriptions;转录后的调控 regulations ; UGA 帽状结构 UAA 定位信号 多聚A尾 5’ m7GpppNm AUG UAG AAUAAA poly(A) 3’; ;Coding RNA mRNA中的编码区（ORF); ;;PNAS, December 19 , 2000 vol 97 no. 26 14035-14037 ;RNomics的内涵;; (I) MicroRNA 简介;microRNA的发现与发展;小鼠 (245);计算机预测各种生物中miRNA基因的数目;miRNAs的重要特点: 时序特异性与组织特异性;(II) miRNA的表达及作用机制;1. miRNA基因在染色体上的分布;Nat. Rev. Genet. 5(7):522-31,2004.;2. miRNAs的发生和作用机制模型;;Cell 118(1), 2004 ;○ 第一种以线虫lin-4为代表，作用时与靶基因不完全互补结合，进而阻遏翻译而不影响mRNA的稳定性，这种miRNA是目前发现最多的种类。 ○ 第二种以拟南芥miR-171为代表，作用时与靶标基因完全互补结合，作用方式和功能与siRNA非常类似，最后切割靶mRNA，这说明某些miRNA和siRNA一样参与了机体内一些特异性mRNA的剪切过程。 ○ 第三种以let-7为代表，它具有以上两种作用模式，当与靶基因完全互补结合时，直接靶向切割mRNA，如果蝇和Hela细胞中let-7直接介导RISC分裂切割靶mRNA；当与靶标基因不完全互补结合时，起调节基因表达的作用，如线虫中的let-7与靶mRNA3′端非翻译区不完全配对结合后，阻遏调节基因的翻译。 ○ 第四种作用时与靶基因3’非翻译区结合，进而影响mRNA的稳定性。;(III) miRNA 的功能;Nature 426 (6968):845-849,2003. Nature 430 (7001):785-789,2004.;Cell 121(7):1097-1108,2005.;miR-1 Hand2 protein Hand2 mRNA Proliferation/growth;Neuron 46(3):363-367,2005.;3.2 miRNA调控造血干细胞的分化;Northern杂交确定了miR-375在INS-1细胞的表达 ;4. miRNA基因异常与肿瘤发生相关;某些定位在染色体的脆性位点(FRAs)的miRNAs与肿瘤的发生有关;Nature 435(7043):834-838,2005.;let-7与肺癌的关系;Nature 435(7043):828-833,2005.;Nature Med 11(7): 713-714,2005.;动物中miRNA的功能;(IV) miRNA的研究方法;1.miRNA基因的寻找;MicroRNA基因确认的基本原则;;;克隆到的miRNAs经过杂交验证其表达 ;Science 299，2003 ;2.miRNA的检测技术;应用芯片技术高通量的检测不同样品中多种miRNA的表达量的差异;NAR 33(2)，2005 ;Science 309(5732):310-311,2005.;3.miRNA的功能的研究方法;PLoS BIOLOGY 2(4):E98, 2004 ;Nature 423, 2003;Curr.Opin.Chem.Biol. 7(4):516-523,2003.;(V) miRNA and SNPs;Functional analysis of SNPs;Association study of MDM2;microRNA target prediction;SNP TC;SNP modulate miR-25 binding on structure and stability;SNP modulate miR-32 binding on structure and stability;There are also predicted microRNAs, which are not likely to be real regulators