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;定義:利用電腦輔助資料管理系統從基因體(Genomic)、蛋白質體(proteomics)或藥物篩選資料庫中蒐集、整合、及分析大量的生物序列或資訊。;序列資料貯存
- (6 * 106序列檔案/one genome) * 6 * 200 KB/序列檔案
序列資訊整理
- BLAST, FASTA….
序列資訊分析
- Assembly, repetitive sequence…..
序列功能註解
- Genome annotation, molecular modeling…;涵蓋分子生物、資訊工程、統計等學門的新科學;後基因體分析紀元(Post-genome Era); ---基因註解
---基因預測
---蛋白質功能研究(proteomics)
---單核甘酸多樣性(single nucleotide polymorphisms or SNPs);Different technologies and resources into a proteomic process ;LITERATURE (文獻)DATABASES ;資料庫的類型:依功能區分;/dbEST/index.html;;;SMART - Simple Modular Architecture Research Tool ;;NCBI;網路資源 vs. 套裝軟體;網路資源 vs. 套裝軟體;網際網路上的生物資源
Search Engine;網際網路上的生物資源
Databases;網際網路上的生物資源
Software (DNA annotation);網際網路上的生物資源
Software (Protein annotation);網際網路上的生物資源
Courses;Bioinformatics Package Tools;Bioinformatics Package Tools;Literature, Bibliography and Reference Databases;MIM(Mendelian Inheritance in Man);Browsing OMIM ;;Nucleotide sequence databases;The International Nucleotide Sequence Database Collaboration (INSD) ;Genebank;Protein sequence databases;SPTrEMBL;Primary sequence could be further analysis………;Nucleotide related databases;Locuslink ;PDB;二維電泳資料庫;2D Gel;預測人類的基因;Pfam http://sanger.ac.uk/cgi-bin/Pfam/getacc?PF02024;http://biochem.ucl.ac.uk/bsm/pdbsum/1ax8/main.html;CGAP;;目前完成之生物資訊平台:
人類基因體序列搜尋系統(Human genome blast server)
34種微生物基因體序列搜尋系統
變異基因資料庫(HGV Database)
單核甘酸多型性(SNP)加值型資料庫以及網頁介面資料輸入及搜尋系統
表現序列分析系統(EST analysis system)
南區生物資訊教育選課系統;谢谢欣赏
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