lncrna研究策略之:rnapulldown实验技术.docxVIP

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  • 2020-11-25 发布于山东
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lncrna研究策略之:rnapulldown实验技术.docx

【实验技巧】 lncRNA 研究策略之: RNA Pull Down 实验技术 lncRNA 研究策略之: RNA Pull Down 实验技术 RNA pull-down  是检测  RNA结合蛋白与其靶  RNA之间相互作用的主要实验手段之一。  RNA pull-down  使用体外转录法标记生物素  RNA探针,然后与胞浆蛋白提取液孵育,形成  RNA-蛋白 质复合物。该复合物可与链亲和素标记的磁珠结合,从而与孵育液中的其他成分分离。复合物洗脱后,通过 Western Blot 实验检测特定的 RNA结合蛋白是否与 RNA相互作用。 1) lncRNA 筛选: 通过 lncRNA 芯片或 RNA测序 等方法对多对疾病模型和对照样本组织进行 lncRNA 表达谱分析; 通过 生物信息 学的方法筛选出具有表达差异的 lncRNA ,构建共表达网络, 预测 lncRNA 的靶基因; 通过 PCR或 Northern Blot 技术对候选 lncRNA 验证,确定其表达差异。 2) lncRNA 确定: 通过 5 RACE 获取  lncRNA 5  全长,  3 RACE  获取  lncRNA3  全长,最终拿到完整的  lncRNA 序列。 表达分析: 细胞水平表达 :在细胞水平进行检测表达差异。 组织分布 :检测不同组织、不同阶段表达特性。

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