【代码M0201】PCR引物设计方法.docxVIP

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  • 2020-11-26 发布于贵州
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【代码M0201】PCR引物设计方法 2016-03-23实验管家 实验管家 引物设计的软件有很多,PRIMER3,Primer Premier 5.0,PRIMER EXPRESS等都可以。下面以Primer3为例做介绍(还看不明白的,师弟找师姐,师妹找师兄问哈) 首先,要先对PCR目的序列的长度有个大致估计: 第一步:找到Primer3的站点。网址是http://bioinfo.ut.ee/primer3-0.4.0/。(也可以访问新版网站:http://primer3.ut.ee/) 第二步:贴上模板序列。进入Primer3站点,可以看到一个引物设计的界面。(附件Word文档里有图)在“Paste source sequence below (5-3…..”下面的大空框里面把你的模板序列粘帖进去。注意是5-3方向的,数字或者空格都没关系,软件会自动过滤的 第三步:重要参数设定。”,默认值一般可以用,但是,当你用熟了这个软件,你自己就知道该怎么改了。 第四步:Pick primers:点一下这个按钮,符合你大小预期的primer就出来了,看看Primer3 Output的界面,多么漂亮!你要的primer出来了,而且有primer在序列上的位置比对图,还要primer本身的信息,包括位置,长度,Tm,GC含量,任何位置互补碱基数,3端互补碱基数,以及引物序列,(注意,下游引

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