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感谢群里Zhangdong 和Raindy老师推荐ITOL,最近就不想用以前的软件查看编辑系统
发育树了。整理此帖,感谢那些在学习系统进化路上无私帮助我的朋友们。By 王超群
进入正题:
1 搜索itol后进入如下界面,点右上角Login 进入系统
2 新用户需要点regist
老用户直接输入用户名和密码
3 进入My trees
4
把树文件拖入框中即可 4 本页可见该系统发育树文件的基本信息:
Leaves = tips
Features 显示树是否有支持率,树形等
如果您不喜欢酷炫的玩法
可以点Upload tree files 上
最右边的齿轮点开后可以编辑树文件名等
传树文件
文献:Letunic I and Bork P (2006) Bioinformatics 23(1):127-8 Interactive Tree Of Life
(iTOL): an online tool for phylogenetic tree display and annotation
Letunic I and Bork P (2011) Nucleic Acids Res doi: 10.1093/nar/gkr201 Interactive Tree
Of Life v2: online annotation and display of phylogenetic trees made
Letunic I and Bork P (2016) Nucleic Acids Res doi: 10.1093/nar/gkw290 Interactive Tree
Of Life (iTOL) v3: an online tool for the display and annotation of phylogenetic and
other trees
5 点树文件名进入编辑环节
在界面左上角可以进行如下操作 6 在界面右上角可
以看到Controls
从上到下依次: Basic 下面可以设计
树的形式、枝长等,
放大
点开试一试吧
缩小
还原到当前窗口
树的信息
7 整个树的位置可以随心拖拽
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