中国被孢霉属及近缘属的分类与分子系统发育研究.pdfVIP

摘要 摘要 被孢霉属(Mortierella Coem. 1863)隶属于真菌界，接合菌门，被孢霉纲，被孢霉 目的被孢霉科。该属真菌全球广泛分布，生物多样性丰富，在生物技术和生物转化 上具有重要的价值，同时还引起动植物病害。我国目前采用的被孢霉属分类系统仅 依据形态特征，而当今系统学已经进入形态结合分子的时代。虽然真菌首选分子条 形码ITS rDNA 已经得到广泛应用，但仍然无法解决所有问题。随着生物资源的全 球化，辅助分子条形码的筛选日渐成为必需。为了给工农业提供支撑，本文开展我 国被孢霉属形态分类和多基因分子系统发育学研究，并籍此筛选其辅助分子条形 码。 形态上，本文在被孢霉属已有的6 个组之外，建立了一个新的Indohii 组。分 离和收集到中国被孢霉总计376 株，鉴定出43 个分类单元，含 8 个中国新记录种 和8 个疑似新种。中国新记录种包括类变形被孢霉(Mortierella amoeboidea) 、南极被 孢霉(M. antarctica) 、贝勒被孢霉(M. bainieri) 、贝科瓦被孢霉(M. beljakovae) 、球詹 金氏被孢霉(M. cystojenkinii) 、纤细被孢霉(M. fimbricystis) 、巨囊被孢霉(M. macrocystis)和华美被孢霉(M. pulchella) 。本文对8 个疑似新种进行了宏观与微观形 态的详细描述并进行了图示，对比讨论了相似种间的区别，更新了中国被孢霉属分 组和分种检索表。 多位点分子系统发育分析显示，被孢霉属并非单系群，隔丝霉属(Dissophora) 、 小加姆斯霉属(Gamsiella)和裂孢囊霉属(Lobosporangium)等三属并入其中。因此，本 文将这些属作为被孢霉属的异名处理，同时进行相应物种的新组合处理。根据种间 分子系统发育关系，本文认为孢囊孢子的形状并不具有系统发育信息，在分类系统 中应该作为次要的形态特征，而具有系统发育信息的孢囊梗分枝情况应该作为主要 的形态特征。 基于 PCR 扩增和测序成功率、系统发育信息、平均种内和种间相似率等指标 的综合评估，初步筛选出LSU rDNA 作为被孢霉属的辅助分子条形码。 通过本文的研究，对被孢霉属分类系统进行了更新和修订，建立了新组，报道 了中国新记录种，发现了疑似新种，重建了其分子系统发育历史，重新评估了其形 态特征，初步筛选出该属辅助分子条形码。论文丰富了我国该类群真菌资源，研究 I 摘要 结果对我国有益被孢霉的开发和有害菌的防治奠定了基础。 关键词：被孢霉科，形态分类学，分子系统发育学，新组，新种 II 目录 目录 1 引言 1 1.1 被孢霉属的重要性1 1.2 被孢霉属及其近缘属的形态分类学研究进展2 1.2.1 形态分类学研究历史2 1.2.2 形态分类依据4 1.2.3 形态分类学的局限性6 1.3 被孢霉属及其近缘属分子系统发育学研究进展6 1.4 中国被孢霉属系统学研究进展7 1.5 DNA 条形码在真菌菌种鉴定上的应用8 1.6 研究目的和意义9 2 材料和方法 10 2.1 实验材料 10 2.1.1 菌株 10 2.1.2 仪器与设备10 2.1.3 试剂与培养基10 2.1.4 软件 12 2.2 实验方法 12 2.2.1 菌种分离12 2.2.2 菌株纯化13 2.2.3 菌种保藏13 2.2.4 形态学观察和描述14 2.2.5 DNA 提取14 2.2.6 PCR 扩增及测序14 2.2.7