NTsys-pc2.1图解使用说明（详细解析）(word文档良心出品).docxVIP

NTsys-pc2.01图解使用说明 1 数据的录入方法： 1）利用Ntedit直接录入数据 0、1二元数据中的数据缺失记为 2。其中列标可以写为样品编号 （条带编号），在No.rows 栏中写入0、1数据总数，No.cols栏中写入样品总数。文件另存为 *.nts格式。 2）从 2）从excel表中直接读入数据 Excel表中输入数据格式如下图。 A1必须为1，B1为0、1数据总数，C1为样品总数。 F Hlr3Iri F Hlr3IriITSMIrTMH □■J. 一 L，「- -1 「一 1I一 打开Ntedit程序，选择从Excel表输入，结果见上图。文件另存为 *.Nts格式 3）从文本文件读取数据: 2.聚类分析 Ntsys-pc2.02界面如下 以下以图中数据为例介绍聚类过程： 2.1首先用similarity程序组中的Qualitative data计算形似系数矩阵。Coefficient通常选用SM 或DICE，结果输出到另一文件。 22以上步的结果作为in put file利用Clusteri ng程序组中的SHAN或者Njoi n进行计算，聚 类分法选用 UPGMA， ties选用FIND， Maximum no. tied trees至少大于样品数。 Njoin程序组界面如下，rooting method可以选用 Outgroup，但需输入外元。 2.3将SHAN或NJoin方法得到的tree file文件输入到 Graphics程序组中的tree plot程序中 计算 得到树图如下 利用options可以对树图进行描述与处理。