1.6原核微生物的分类鉴定（一）.pdf

原核微生物的分类与鉴定 第一部分：生物分类的体系简介 1.1、 对生物进行分类的两种原则和体系：  生物分类学的内容：鉴定、命名、分类  传统的分类原则：根据表形特征(如形态、生理)的相似 程度分类、归群。重在应用，不以反应生物之间的进 化关系为目的  现代分类原则：通过比较不同物种间基因序列的相关 性来分类，目的是探寻各物种间的进化关系，建立反 映生物发育相关性的分类系统。  原核生物的分类：由于缺乏化石依据，无法了解原核生 物之间的系统发育关系，长期以来，一直以表型特征作 为原核生物的分类依据。 自从20世纪70年代末 Carl Woese 根据16SrRNA 的分 析提出生物分类的三域学说以后，原核生物的分类进入了 系统发育分类时代。 1.2 、传统的分类体系 • 1753年：瑞典植物学家林奈 （Carl von Linne） 两界分类系统：动物界 植物界 • 1969年：美国 惠特克 • （R.H. Whittaker）： • 五界分类系统 原核生物界 （Monera） 原生生物界 （Protista） 真菌界 （Fungi） 植物界 （Plantae） 动物界 （Animalia） 1.3 、现代系统发育的分类体系：三域分类学说  20世纪70年代，沃斯 （Carl Woese）根据生物核糖体中 18SrRNA 和 16SrRNA 的碱基序列相似性，将生物划分为3 个 “域 （domain) “ 或称 “原界”： 古细菌原界 （Archaea）： 甲烷菌，嗜盐菌，嗜热菌等 真细菌原界 （Bacteria）： 除古细菌外的其它原核生物 真核生物原界 (Eukarya)：原生生物、真菌、动物、植物 1.4 、原核微生物的分类单元： 1.4.1、种是微生物基本分类单元 界 （Kingdom) 、门 （Phy lum）、纲 （C lass）、目 （Order） 、科 （Fam ily）、属 （Genus）、 种 （Spec ies） 1.4.2、 种的定义在原核生物和真核生物中的差别：  真核生物： 演化生物学家恩斯特 ·麦尔Ernst Mayr对 “种”的定 义 ：能够 （或可能）相互配育的自然类群，这些类群与 其它这样的类群在生殖上相互隔离着。  原核生物 ：原核生物的种是由一群表型特征和包括 16SrRNA在内的基因序列特征高度相似的菌株群组成 ，而且这个菌株群和其它类群有明显差异。  每个原核生物种应选取一个模式菌株 （type strain） 作为代表 1.4.3、种以下的分类概念： • 菌株 （strain） • 亚种 （subspecies) • 型 （form）：生物型(biovars)、 血清型(serovars)、 噬菌体型…… 思考题：  对生物分类的依据或原则有哪两大类？  介绍R.H. Whittaker的五界分类系统和 Carl Woese的三原界分类系统。  原核生物对 “种”的界定与真核生物有什么不同？  原核微生物 “种”以下还有哪些分类单位？