3 2常用的数据库操作演示下.pdfVIP

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2021-02-19 发布于北京
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医学生做基础科研，发表1-3 分文章的四个套路小张聊科研团队课程内容一：临床样本出发的研究；二：细胞功能为主的研究；三：动物模型出发的研究；四：高通量组学为主的研究；第一部分临床样本出发的研究课程内容一． 套路介绍二． 文章案例解读三． 常用的数据库操作演示四． 实例展示如何和作图五． 从结果到成文六． 杂志选择七． 关键问题和注意事项三. 常用的数据库操作演示（下） IF 2.4 GEO DataSets 甲基化表达谱检测非编码RNA 蛋白表达基因组结合，比如转录因子基因组变异（包括SNP ）数据一 GSE54129 分组选择结果展示数据二 GSE26942 分组选择结果展示数据三 GSE79973 分组选择结果展示一些参数的说明 1. 差异基因筛选数据一 GSE54129 2^(2)=4 数据一 GSE54129 显著差异表达基因: P0.05, adj.P0.05，（上调或下调）倍数大于等于4 倍 763条文件 Excel “数据一 GSE54129 Gene Symbol ” 数据二 GSE26942 4倍 81条 2倍 496条显著差异表达基因: P0.05, adj.P0.05，（上调或下调）大于等于2 倍 394条文件 Excel “数据二 GSE26942 Gene Symbol ” 数据三 GSE79973 显著差异表达基因: P0.05, adj.P0.05，（上调或下调）倍数大于等于4 倍 415条文件 Excel “数据三 GSE79973 Gene Symbol ” 2. 共同差异分析方法一、工具软件： FunRich Funconal Enrichment analysis tool 网址：hp:/// FunRich软件主界面输入组名输入基因名数据一未找到的基因名数据二数据三单击初步的Venn 图颜色