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蛋白质组学在农林研究中的 应用与进展 金 菁 上海中科新生命生物科技 Shanghai Applied Protein Technology Co.,Ltd 蛋白质组研究 中心 Research Center of Proteomics Analysis 内 容 •蛋白质组学及其技术的简介 •蛋白质组学技术在农林研究中的应用思路及案例解析 蛋白质组学技术在农林研究中的适用方向 蛋白质组学技术在农林研究中的应用思路（1 ）——差异蛋白质组学 蛋白质组学技术在农林研究中的应用思路（2 ）——差异蛋白质组学与其 他组学数据整合 蛋白质组学技术在农林研究中的应用思路（3 ）——针对单个蛋白质进行 生物学功能研究 蛋白质组学及其技术的简介 蛋白质组学概念和研究重要性 蛋白质组：指组织或细胞中所有的蛋白质的集合。 蛋白质组学：是对蛋白质组特别是其结构和功能的大规模研究。 蛋白质组学研究的必要性和重要性 • 基因和蛋白质间并没有一一对应的关系 • 基因组的直接功能注释 • 蛋白复杂的翻译后修饰 • 蛋白的亚细胞定位 与单个蛋白的研究比较：在整体、 络的水平上对蛋白质进行研究，对生命的复 杂活动进行全面和深入的认识。 蛋白质组学时代已经来临 蛋白质组学及其技术的简介 蛋白质组学的研究内容 蛋白质相 蛋白质表 互作用 达谱 蛋白质复 蛋白质组学 合物组成 蛋白质组 翻译后修 差异比较 饰鉴定 农林研究 蛋白质组学及其技术的简介 蛋白质组学技术方法分类 蛋白质鉴定 蛋白质，组织、 蛋白质修饰（磷酸化/ MALDI TOF/TOF 细胞、亚细胞、 乙酰化/糖基化…） （较纯样品） 体液等的蛋白提 定性研究 取液 大规模表达谱构建 LC-MSMS(shotgun) (复杂混合样品) 蛋白质相互作用（IP ） 蛋白质组学 非标记：2D 基于凝胶技术 标记：DIGE