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DNA的复制机制 所有的生物体在每个细胞分裂之前必须以非同寻常的准确度复制其 DNA。在这一部分,我 们将探索生物体内一个精巧的“复制机器”在以 1000个核苷酸每秒的速度复制 DNA的同 时,是如何达到这一准确度的。 碱基配对是 DNA复制和DNA修复的基础 第一章已经简单讨论过, DNA模板化是一条 DNA链(或选定的部分)的核苷酸序列通过 碱基互补配对(A与T, G与C)被拷贝出一条互补的 DNA序列(Figure 5-2)。该过程需要 DNA模板链中每个核苷酸被一个自由的(未聚合的)互补核苷酸识别,而且要求 DNA螺 旋的两条链被分开。这一分开,使得每个 DNA碱基上的氢键的供体或受体基团暴露出来, 以便和进来的合适的自由核苷酸配对,为其酶催化聚合为一条新 DNA链校准。 Figure 5-2 DNA双螺旋作为自身复制的模板。 因为核苷酸 A只能和T成功配对,G之S flrand Figure 5-2 DNA双螺旋作为自身复制的模板。 因为核苷酸 A只能和T成功配对,G之 S flrand flflw S 丰trvnQ 和C,所以DNA的每条链都作为一个模板通过碱基配对来指定其互补链的核苷酸序列。这 样,一个双螺旋DNA分子可被精确复制。 第一个聚合核苷酸的酶, DNA聚合酶发现与1957年。作为该酶底物的自由核苷酸是三磷 酸脱氧核糖核苷,它们聚合为DNA要求一个单链模板。这一反应的逐步机制在 Figures5-3 和5-4中说明。 Figure 5-3 DNA的合成化学T Aftfl E ICIAfd一个脱氧核糖核苷酸被加到一条多聚核 Figure 5-3 DNA的合成化学 T Aftfl E ICIAfd 苷酸链(引物链)的 3 ‘端是DNA合成 的基础反应。如图所示,一个新来的三磷 酸脱氧核糖核苷和一条存在的 DNA链 (模板链)进行碱基配对,引导新 DNA 5 Eriphcsphaldnpnrwir strsnidtivariidiricomlny ifaonijc loo ai 占耻5 to-T erf Ghain growthfncorrvingRd。昇” rilMunuci HOil! d apmrTi 备 i Errandiripha-splhatE 5 Eriphcsphald n pnrwir strsnid tivariid iricomlny ifaonijc loo ai 占耻 5 to-T erf Ghain growth fncorrving Rd。昇” rilMunuci HOil! d a pmrTi 备 i Errand iripha-splhatE °thiiEtr lemptlaw 9T4jiril W口 in belix Figure 5-4 由DNA 聚合酶催化的 DNA 合成 (A )如图所示,DNA聚合酶催化一个脱氧核糖核苷酸向一条多聚核苷酸链(引物链,已 和另一模板链配对)的 3 ‘ -OH端的逐步添加。新合成的 DNA链因此是以5 ‘ -3 的方向 聚合的,正如前一幅图所示。因为每个新来的三磷酸脱氧核糖核苷必须和模板链配对以被 DNA聚合酶识别,模板链决定了哪种脱氧核糖核苷酸( A,T,C,或者G)将被添加。焦磷酸 驱动了脱氧核盐的释放及其后续水解为两个无机磷酸盐分子导致巨大的有利的自由能改变, 驱动了脱氧核 苷酸的添加反应。(B) 一个由X-线晶体学确定的大肠杆菌 DNA聚合酶分子结构。通俗的 讲,它就像一只右手,手掌手指和大拇指握住 DNA。该图示例的是一个在 DNA修复时起 作用的DNA聚合酶,但是复制 DNA的酶有相似的特征。 DNA复制叉非对称 在细胞内DNA复制期间,每条旧 DNA链都作为形成一条完整新链的模板。因为一个分裂 细胞的两个子细胞都遗传了包含旧链和新链的新 DNA双螺旋(Figure 5-5 ),该DNA双螺 旋据说是被DNA聚合酶半保留复制。这一任务是如何完成的呢? Figure 5-5 DNA 复制的半保留性质 在一轮复制中,DNA的每条链都用左形成互补链的模板。 原 始链因此经历很多代而完好无损。 I960年代早期对完全复制的染色体进行的分析发现,一个局部的复制区域沿母 DNA双螺 旋向前移动。因其 Y形结构该活跃区域被称为复制叉( Figure5-6 )在复制叉处,两条新的 子链被一个包含 DNA聚合酶在内的多酶复合 物合成。 ■ I1 Jim ■ I 1 Jim 一个活跃的DNA复制区域沿正在复制的 DNA 分子向前移动,形成一个 Y形DNA结构即复制叉:Y的两条臂是两个子 DNA分子,Y的 茎是母DNA螺旋。图中,母链为橙色;新合成的链为红色。 DNA合成中不存在 3 ‘ -5 的DNA聚合,只有5 ‘ -3 上添加下一个核苷酸

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