microRNA引物设计原则.docxVIP

1, 下载所有人的microRNA数据，进行所有micro RNA的两两比对，得到如下所示的文件： 2、找到目标miRNA, 例如miR-495-3p，同时分析其上下的miRNA，找到与之在3端同源的那些miRNA，删除同源的那部分序列，并在5端添加若干G碱基，使Tm值合适。例如：要设计miR-495-3p的引物 hsa-miR-495-3p -------------AAACAAACATGGTGCACTTCTT-------- hsa-miR-543 -------------AAACATTCGCGGTGCACTTCTT-------- 删除黄色部分，得到AAACAAACAT，添加若干碱基，是Tm值为60.4，得到GGGGGGGGGGGAAACAAACAT。