第九章微生物的分类和鉴定课件.ppt

二、现代方法 （一）通过核酸分析鉴定微生物遗传型 1. DNA 碱基比例的测定 （ G+C ） mol % = G + C A + T + G + C × 100% GC 比具有 3 个特点： 亲缘关系相近的种，两者的 GC 比也接近 ； 反之， GC 比相 近的两个种，它们的亲缘关系则不一定都很相近。 如链霉菌属中的 500 余个种的 GC 比在 65% -74% 的范围。 如酿酒酵母、枯草杆菌和人的 GC 比十分接近。 ? GC 比差距很大的两种微生物，它们的亲缘关系必然较远。 牛型放线菌（ 63% ）、大肠杆菌（ 51% ）和鼻疽诺卡氏菌 （ 71% ） ? GC 比相差低于 2% 时，没有分类学上的意义；种内各菌株 间差别在 2.5%-4.0% 间；若相差在 5% 以上时，就可以认为 属于不同的种了；假如差距超过 10% ，一般就可以认为是 不同的属了。 ? 螺菌属（ 38%-66% ） → 螺菌属（ 38% ）、海洋螺菌属 （ 42%-51% ）、水生螺菌属（ 49%-66% ） ? 各大类生物 GC 比的范围不同，有的很宽，有的很窄。 ? 每个生物种都有特定的 GC% 范围，因此后者可以作为分类鉴 定的指标。细菌的 GC% 范围为 25--75% ，变化范围最大，因 此更适合于细菌的分类鉴定。 ? 在疑难菌株鉴定、新种命名、建立一个新的分类单位时， G+C 含量是一项重要的，必不可少的鉴定指标。 ? G+C 含量的比较主要用于分类鉴定中的 否定 ? 其分类学意义主要是作为建立新分类单元的一项基本特征 和把那些 G+C 含量差别大的种类排除出某一分类单元。 2. 核酸分子杂交法 是测定核酸分子同源程度和不同物种间亲 缘关系的有效手段。 ? 有 DNA-DNA 、 DNA-rRNA 、 rRNA-rRNA 分子间 的杂交。 ? 不同生物 DNA 碱基排列顺序的异同直接反映生物之间亲缘关系的 远近，碱基排列顺序差异越小，它们之间的亲缘关系就越近，反 之亦然。 核酸分子杂交 (hybridization) 间接比较不同微生物 DNA 碱 基排列顺序的相似性 a ） DNA-DNA 杂交； （亲缘关系相对近的微生物之间的亲缘关系比较） b ） DNA-rRNA 杂交； （亲缘关系相对远的微生物之间的亲缘关系比较） c ）核酸探针； （利用特异性的探针，用于细菌等的快速鉴定） 分类： 通过收集大量描述有关个体的文献资料，经过科学 的归纳和理性的思考，整理成一个科学分类系统。 或是根据微生物的相似性和亲缘关系，将微生物归入不 同的分类类群。 ? 鉴定： 通过详细观察和描述一个未知名称纯种微生物的各 种性状特征，然后查找现成的分类系统，以达到对其知类、 辨名的目的。 或是确定一个新的分离物属于已经确认的分类单元的过 程。 ? 命名：是为一个新发现的微生物确定一个新学名，亦即当 你详细观察和描述某一具体菌种后，经过认真查找现有的 权威性分类鉴定手册，发现这是一个以往从未记载过的新 种，这时，就的按微生物的国际命名法规给予一个新的学 名。 ? 第一节 通用分类单元 一、种以上的系统分类单元 （一） 7 级分类单元 ? 界 Kingdom ? 门 Phylum ? 纲 Class ? 目 Order ? 科 Family ? 属 Genus ? 种 Species 种是最基本的分类单位 当必要时，各级都可补充若干辅助单元，有 “亚”、“超”或“族”。 以啤酒酵母为例，它在分类学上的地位是： ? 界 (Kindom) ：真菌界 ? 门 (Phyllum) ：真菌门 ? 纲 (Class) ：子囊菌纲 ? 目 (Order) ：内孢霉目 ? 科 (Family) ：内孢霉科 ? 属 (Genus) ：酵母属 ? 种 (Species) ：啤酒酵母 （二）种的概念