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- 2021-09-25 发布于天津
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分子对接教程在窗口打开一个有小配体的蛋白或文件点击使质子化点击打开面板删去水分子和与小配体无关的其他杂配体或离子在窗口右边点击点击改变配体颜色使得小配体显示绿色骨架在窗口点击在窗口点击改变口袋表面的透明度在面板调节如图所示在窗口会看到如下图所示接下来对接一个小配体点击在选项选择其它选择默认值点击在表单你会看到有不同的构象对接结果包括值口袋对接结果创建一个药效团模型在窗口点击点击这样会创建基于受体的药效团特征点击口袋中显示的小球然后点击这样在对接口袋就会显示药效团化合物数据库的对接关闭面板在窗口点
MOE 分子对接教程
1. 在 MOE窗口 open 打开一个有小配体的蛋白( PDB或 moe文件)
点击 Compute→prepare →Protonate 3D (使质子化)
点击 OK。打开 SEQ面板
删去水分子和与小配体无关的其他杂配体或离子
在 MOE窗口右边点击 SiteView
点击 System,改变配体颜色
使得小配体显示绿色 C 骨架
在 MOE窗口点击 S
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