高通量测序在临床精准诊断中的应用.pptVIP

2021/1/12 CNV-Seq应用领域 流产原因查找 产前〔羊水、脐血〕检测 不孕不育原因查找 染色体疾病先证者的染色体异常检测 2021/1/12 CNV-Seq技术操作流程 2021/1/12 CNV-Seq针对的人群 产前诊断： 具有染色体疾病家族病史的夫妇 死胎、反复性流产，需要查明原因的夫妇 曾经生育有出生缺陷患儿的孕妇 染色体核型分析结果为正常，但超声显示构造异常的胎儿及其父母 胎儿宫内发育缓慢 先证者遗传病诊断： 染色体核型分析正常，但临床表现为发育缓慢、智力低下、自闭、各种畸形、生育障碍等的患者及其父母 其他医学检测为染色体疾病，需要确诊的患者 2021/1/12 NGS在胚胎植入前遗传学筛查中的应用〔PGS) 2021/1/12 PGS临床流程 2021/1/12 检测内容： 全部染色体非整倍体 大于4Mb的新发的染色体微缺失/微重复 大于1Mb的遗传自父母的染色体微缺失/微重复 ? 使用范围: 高龄患者〔≧35岁〕 有反复流产史的患者〔自然流产≧3次〕 反复胚胎种植失败的患者〔失败≧3次〕 生育过染色体异常患儿的夫妇 自身染色体数目或构造异常的夫妇 严重的男性不育〔SMF〕，少弱精子症、畸精症 自愿承受胚胎染色体异常排查的夫妇 PGS检测内容及适用范围 2021/1/12 对NGS在PGS应用的考虑 高灵敏NGS技术的测序环境防污染系统的建立 单细胞测序 操作者脱落细胞的污染？ 样本与植入物的一致性问题 胎盘/胎儿染色体构造差异〔也叫局限性胎盘嵌合，cpm〕现象在生殖领域〔PGS〕也存在，详细指囊胚活检样本与其内细胞团染色体构造不一致，发生比例大概1-10%，因为研究难度较大，详细数字还没有共识。 注册审批的难度 1)国家标准物质研制 2)临床试验的难点? 2021/1/12 NGS在肿瘤分子诊断中的应用 *每10万人发病人数 **每10万人死亡人数 数据来源：全国肿瘤登记中心的?中国肿瘤登记年报? 前十大肿瘤发病占肿瘤整体发病比例76.39% 前十大肿瘤死亡占肿瘤整体发病比例84.27% 发病率* 每年新发3,120,000人 死亡率** 每年死亡2,700,000人 肺癌，54人 胃癌，36人 结直肠癌，29人 肝癌，29人 食管癌，22人 乳腺癌，21人 胰腺癌，7人 淋巴癌，7人 膀胱癌，7人 甲状腺癌，7人 肺癌，46人 肝癌，26人 胃癌，26人 食管癌，17人 结直肠癌，14人 胰腺癌，7人 乳腺癌，5人 白血病，4人 脑癌，4人 淋巴癌，4人 2021/1/12 多种临床肿瘤分子诊断需求 全面的基因检测 多种样本类型 可进展疗效监测 靶向用药相关基因 化疗用药相关基因 肿瘤易感性相关基因检测 肿瘤发生相关基因检测 血液样本 小标本组织样本 大标本组织样本 准确定量 高通量测序在临床精准诊断中的应用 高通量测序在临床精准诊断中的应用高通量测序在临床精准诊断中的应用高通量测序本钱迅速下降第一次人类基因组测序耗时13年，本钱30亿美元，到年11月，基因组测序仅需一两周，花费10万美元。新一代仪器可将全基因组序列测序本钱降到1000美元以下，本钱缺乏第一代的百万分之一。而且随着技术进步，仍在不断下降。本钱快速下降，测序领域的超摩尔定律助推临床应用22021/1/12 2021/1/12 高通量测序本钱迅速下降 第一次人类基因组测序耗时13年，本钱30亿美元，到年11月，基因组测序仅需一两周，花费10万美元。新一代仪器可将全基因组序列测序本钱降到1000美元以下，本钱缺乏第一代的百万分之一。而且随着技术进步，仍在不断下降。 本钱快速下降，测序领域的超摩尔定律助推临床应用 2021/1/12 测序设备开展现状 第一代〔稳定需求〕 ABi 3130xL(FDA CFDA) 3730xL 3500xL〔FDA CFDA〕 第三代 Life Technologies (ABi) Ion Torrent PGM? Helicos Biosciences Helicos Genetic Analysis System Pacific Biosciences RSSystem 第二代〔高速开展〕 Roche Genome Sequencer FLX System GS Junior System Illumina Genome Analyzer IIx MiSeq HiSeq 1000 HiSeq 2000 HiSeq 2500 Life Technologies (ABi) 5500 SOLiD? System 5500xL SOLiD? System DanaherMotion Com