磷酸二酯键分析和总结.pdf

磷酸二酯键（英语：phosphodiester bond）也称为“3,5-磷酸二酯键”或“磷酸双酯键”， 是核酸分子中的磷酸基团的磷原子与另外两个五碳糖分子的碳原子之间形成的共价 键。这种形式的键结于DNA 及RNA 分子中负责将分别位于两个核糖上的3 号碳与 5 号碳连结起来。 磷酸二酯是指一个磷酸分子与两个醇羟基发生酯化反应形成的产物，磷酸二酯键应该指 两个共价键，一个是单个核苷酸内部的磷酸酯键，一个是连接相邻两个核苷酸之间的磷酸酯 键。而限制酶作用的部位应是3,5 磷酸二酯键，即连接相邻两个核苷酸之间的磷酸酯键。 酶的切割方式。限制性内切酶作用于双链DNA，水解核苷酸磷酸二酯键中3’位的酯键， 产生3’端带羟基、5’端带磷酸基团的片段 从这里可看出，磷酸二酯键含二个共价键，但限制酶只水解磷酸二酯键中3’位的酯键 限制性内切酶作用a 处酯键，切割了此处也就破坏了磷酸二酯键；DNA 连接酶重新形 成a 处酯键，链接a 处也就重新形成了磷酸二酯键。 ▲DNA连接酶与DNA聚合酶是一回事吗？为什么？ 答：不是一回事。基因工程中所用的连接酶有两种：一种是从大肠杆菌中分离得到的，称之 为E?coli连接酶。另一种是从T4噬菌体中分离得到，称为T4连接酶。这两种连接酶催化 反应基本相同，都是连接双链DNA的缺口（nick），而不能连接单链DNA。DNA连接酶和 DNA聚合酶都是形成磷酸二酯键（在相邻核苷酸的3位碳原子上的羟基与5位碳原子上所 连磷酸基团的羟基之间形成），那么，二者的差别主要表现在什么地方呢？ （1）DNA 聚合酶只能将单个核苷酸加到已有的核酸片段的 3′末端的羟基上，形成磷酸二 酯键；而DNA连接酶是在两个DNA片段之间形成磷酸二酯键，不是在单个核苷酸与DNA 片段之间形成磷酸二酯键。 （2）DNA聚合酶是以一条DNA链为模板，将单个核苷酸通过磷酸二酯键形成一条与模板 链互补的 DNA链；而 DNA连接酶是将DNA双链上的两个缺口同时连接起来。因此DNA 连接酶不需要模板。 此外，二者虽然都是由蛋白质构成的酶，但组成和性质各不相同。 ▲什么叫磷酸二酯键？ 3,5磷酸二酯键是核酸中核苷酸的连接方式，组成了核酸的一级结构。在核酸中一个核苷酸 核糖上第3 位的羟基与下一个核苷酸核糖上第5 位的磷酸羟基脱水缩合成酯键，该酯键称 3,5磷酸二酯键。若干个核苷酸间以3′,5′磷酸二酯键（图1-2）连接成的多核苷酸链为核酸。 在链的一端的一个核苷酸，其核糖上第5位连接的磷酸只有一个酯键，称此核苷酸为DNA 链的5′磷酸末端或5′端。另一端核苷酸上第3位的羟基是自由的，所以此核苷酸称为3′羟基 末端或3′端。链内的核苷酸第5 位上的磷酸已形成二酯键，第3位上的羟基也已参与二酯 键的形成，故称核苷酸残基。