转录组测序技术原理及应用.pptVIP

Transcriptome resequencing比对流程 第二十八页，共52页。 比对统计 基因表达注释 基因差异表达分析 基因结构优化 可变剪接分析 预测新转录本 cSNP分析 Transcriptome resequencing信息分析主要内容 第二十九页，共52页。 Transcriptome resequencing信息分析流程 第三十页，共52页。 应用---优化转录组注释信息 基因结构优化 可变剪接鉴定 基因融合鉴定 RNA水平SNP分析 第三十一页，共52页。 Genomic intergenic region Reads cluster Paired Reads distribution 优化基因结构鉴定新的转录本 Paired-End (PE) Reads Reads 比对到参考序列基因间区域 第三十二页，共52页。 鉴定可变剪接（ Alternative Splicing ） exon1 exon2 exon3 exon1 exon2 exon3 exon1 exon3 common reads junction reads mRNA 第三十三页，共52页。 鉴定基因融合 Paired Reads Single Reads Gene A Gene B 第三十四页，共52页。 分析RNA水平SNP 转录组重测序比对软件：SOAP De novo 转录组