Cytoscape软件画图说明.docx

Cytoscape软件画图说明 Cytoscape软件画图说明 Cytoscape软件画图说明 Cytoscape软件画图说明 优选文库 1、画图前，先准备两个输入文件。 2、打开 cytoscape 软件，导入数据。 导入 文件 点击 File ----Import ----Network -- 2 优选文库 节点 1，文件中 节点 2，文件中 第一列 第 2 列 连接种类，文件 中第 3列 点击 ok 获得原始图形 -- 3 优选文库 点击 layout ----Apply Preferred Out 改变图形摆列方式 此处可以用鼠标在画布中拖动图形到适合的地点。 改变画布背景。点击左边 Contro Panel ----Style---network ---Backgroud paint -- 4 优选文库 设置节点之间连线的宽度和颜色 Contro Panel ----Style---Edge 颜色 宽度 -- 5 优选文库 导入 node.txt 个文件 点击 File ----Import ----Table -- 6 优选文库 设置节点图形属性 Contro Panel ----Style---Node -- 7 优选文库 1、node 大小 经过设置 Height 和 Width 来控制大小 2、Node 性状 经过设置 Shape 来控制 3、Node 填补色 经过设置 Fill Color 来控制 4、Node 标签的设置 点击 Properties -- Label Position -- 8 优选文库 点击 Label Position 来设置标签地点。 这里是一个示范操作，要认真调整标签地点还是要设 置 Column 和 Mapping Type 两个参数。 设置完成以后图形 调理节点之间的距离 点击 layout ----Scale 鼠标拖动 -- 9 优选文库 最后，画图导出成 pdf 文件 点击 File ----Export----Network View as Graphics -- 10