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精品 SNP 开发 / 验证的研究方法和技术路线 1 分子标记： 分子标记， 我想这部分是我们分子标记组最核心的任务。 现在，我们没有任 何可用的标记检测我们的定位材料。即使想要验证已经定位的 QTLs ，我们也需 要相对应的区间内的分子标记，尤其是 SNP 标记。 1.1 全基因组 SNP —Affymetrix 芯片： 一套完整的全基因组的 SNP 芯片，相对于 Douglas 体系，其操作简单，高 通量。可以直接对定位群体进行初定位的扫描或是对育种材料的背景进行分析。 在国家玉米改良中心， 有一套 3k 的 Illumina 芯片，就是用来对玉米材料进行高 通量检测，基因型检测结果通常可以用来 QTLs 初定位，育种材料的群体划分与 纯度鉴定以及低密度的关联分析等。 在此，我建议我们应该开发一套番茄基因型