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miRNA RT-PCR 引物设计原理
对于miRNA RT-PCR 实验来说,最核心的实验原理和步骤就是miRNA 引物
设计思路。
之前大家熟知的miRNA RT-PCR 引物主要有两种类型:
1、 Oligod(T)特异的RT 引物(QIAGEN 产品为主)
由特异序列+(T)20 左右+兼并碱基V 或VN 组成。(所有miRNA 可以公用一个
Oligod(T)的RT 引物,但是RNA 在反转录前需要进行末端Poly(A)加尾)
2、茎环状结构的RT 引物(ABI 产品为主)
由可以自身呈环茎状的特异序列+6 到8 个 miRNA3’端反向互补碱基组成。(一
条miRNA 序列特异对应一个茎环状结构的RT 引物)。
这里主要给大家介绍美国signosis 公司的一种新方法。
基于自有专利技术,美国 Signosis 开发了一种高灵敏、高分辨的实时 PCR
方法,用于检测miRNA 的表达,其应用寡核苷酸连接和基于实时PCR 的SYBR
gr n 。该方法可用于总RNA 或细胞裂解物中的miRNA 表达的定量分析,无需
进行cDNA 转换。
该方法中,靶miRNA 分子与二对oligo 连接,形成RNA/DNA 复合物。当序
列完全匹配时,这二对oligo 与miRNA 连接,二对oligo 的节点通过DNA 酶连接。
miRNA 之间单个寡核苷酸的差异就会阻止杂交或连接。寡核苷酸对连接上后,连
接分子可进行实时PCR。
以下是signosis 新方法的原理图:
Signosis 的新方法有效地解决了许多同源miRNA 中只有单个碱基的不同而
无法分辨的问题。并且省去了反转录成cDNA 的步骤,同时配有相应的细胞裂解
液产品使实验更简便、更可靠。
想了解更多关于该方法的信息可登陆signosis官方网站:
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中国总代网站:
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