中国极地微生物的研究进展;中国极地微生物学考察研究简史;(一)类别
目前中国所取得的南极微生物主要类别见表2。;;;;(三)极地微生物的开发利用研究;;;;;传统的环境微生物生态学研究方法采用计数、微生物培养及鉴定,生理生化分析等手段进行,这些方法在很大程度上依赖于微生物的培养和纯种分离技术。
纯培养很难,尤其是在南北极这样的极端环境中。现有研究认为在自然界中仅有0.001%一1%的微生物能够用现有的技术手段进行人工培养。而且经过平板培养微生物有机体还有可能会偏离原???自然种群的生理习性,甚至有可能偏离它们原来的基因型组合。
随着各种分子生物学技术的应用,使我们不必培养微生物,而直接通过对环境中的遗传物质的研究来达到目的,也为从分子水平上开展较为全面的、无偏差的微生物生态学研究开辟了新的途径。;(一)从自然样品中直接提取核酸:
从环境样品中提取核酸的方法可分为两类,一是转移后裂解法,即先将微生物菌体与土壤颗粒分开,再提取DNA。另一类是直接裂解法,即在土壤中直接裂解微生物菌体后提取DNA。相比之下,直接裂解法可以提取出沉积物样品中近乎所有的微生物种群,且DNA产量大。在高效裂解细胞的同时对己释放出的DNA不予破坏是提高DNA产出率的决定因素。目前己报道的裂解法有碾磨法、超声波裂解法、液氮冻融法、变性剂热裂解法、酶解法等。
;(二)分子生物学分析;;;;;;;;DGGE变性剂浓度的选择,电泳时间的选择,染色方法的选择
电泳时间的选择:
采用了时间间歇(timetravel)的方法,每隔一小时加一次样,最终根据图谱清晰分离度来确定出最合适的时间。
染色方法的选择:
EB染色后所显现的条带要少一些(只能染双链DNA,不能染单链DNA),所以这种方法的灵敏度要低一些。相较而言,银染法的灵敏度就高了(因为它单双链DNA都能染色)。但是它无法顺利的从条带中回收出DNA。
因次在构建和观察指纹图谱时采用银染法。在要做回收克隆测序的工作时,则采用EB染色。
;③限制性片段长度多态性分析(RFLP, Restriction Fragment Length Polymorphism)RFLP技术的基本原理是根据不同生物个体或种群之间DNA片段酶切位点有所差异的特点,利用限制性内切酶进行消化,产生长短、种类、数目不同的限制性片段,然后对这些特定DNA片段的限制性内切酶产物进行分析。凡是可以引起酶切位点变异的突变包括点突变(新产生和去除酶切位点)、基因插人或缺失(插入和缺失造成酶切位点间的长度发生变化)等均可导致多态性的产生。将PCR技术与RFLP分析相结合,用于研究环境中微生物多样性及群落分布,具体方法是采用特定的引物,如16S rRNA基因通用引物对环境样品的总基因组DNA进行PCR扩增,将扩增产物用不同的限制性内切酶酶切,通过电泳分析比较酶切带型,对特殊带型的序列进行测定,进而了解该样品中所包含的微生物序列信息。该方法广泛用于环境微生物多样性及其群落结构的研究。
;;;;;;;;国际极地微生物考察研究在经历探险、观察、分类描述、获取和保存样品、起源、系统和生理学之后,已开始转入起源、系统、生理及生物学适应机制及其它生态系统、能流、物流中的作用、地位研究。一些成果涉及微生物适应性机理的分子水平的探讨,以及活性物质的应用前景研究,并趋向作为一个分支而参与多学科、综合性的跨地区、跨学科的考察研究。
因此摆在中国学者面前的任务也必须高起点、高标准。就是要高瞻远瞩,有一个系统化的全面综合考虑。投入足量的经费、配备先进的仪器设施,吸引高素质人才,并积极参与国际项目的调查研究,如冰盖、干谷、内陆山脉、极地荒漠、冻土带、深海、环境等领域。尽力争取更多机会参与实地考察,为采集各种样品提供保障,以取得符合微生物学研究要求的第一手样品,为后续的精心研究提供支持。扩大研究内涵,并不断深化。从微生物的鉴定、生态环境、微生物与环境的相互作用,如在元素迁移循环、食物链/网/环、生态系统中的作用,治疗人体疾病及生物活性物质的开发利用等等,持之以恒地研究下去。
打好坚实的基础,注重原创性研究,尽可能高水准地科学认知、开发和利用好极地微生物这一宝贵资源,真正造福于全人类,并使之永久持续健康发展。
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