真核生物基因结构的预测分析方法软件与“序列”有关的文档.pptx

真核生物基因结构的预测(Ce)分析方法软件第一页，共四十九页。课程(Cheng)内容实习一基因组数据注释和功能分析实习二真核生物基因结构的预测分析 实习三芯片的基本数据处理和分析实习四蛋白质结构与功能分析实习五蛋白质组学数据分析实习六系统生物学软件实习基因组(Zu)学系统生物学转录物组学蛋白质组学第二页，共四十九页。蛋白质理化性质二级结构预测结构域分析重要信号位点分析三级结构预测编码区预测翻译蛋白质序列基因结构分析序列比对功能注释KEGGGO系统发育树Codon biasGC Content限制性酶切位点选择性剪切转录调控因子基因组功(Gong)能分析基因组(Zu)序列cDNA序列第三页，共四十九页。真核生物(Wu)基因的主要结构第四页，共四十九页。基因结构(Gou)分析常用软件基因结构分析开放读码框GENSCANGENOMESCANCpG岛CpGPlot转录终止信号POLYAH启动子/转录起始位点PromoterScan密码子偏好分析CodonWmRNA剪切位点NETGENE2Spidey选择性剪切ASTD第五页，共四十九页。开放读码框(Kuang)的识别开放读码框（open reading frame, ORF) 是一段起始密码子和(He)终止密码子之间的碱基序列ORF 是潜在的蛋白质编码区第六页，共四十九页。基因开放阅读框/基因结构分析识别工具ORF Finder /gorf