Vector-NTI-中文使用说明书.pdfVIP

Vector NTI 7.0 Users Manual 软件包中文翻译者：宋厚辉〔浙江大学〕 前言〔 Introduction 〕 1. 程序附带的 数据库〔 Vector NTI database 〕包括： DNA/RNA 、蛋白质、内切酶、寡核苷 酸、凝胶 mark 。此外程序还提供数据库开发〔 Database Explorer 〕功能，用户可以自己 修改、添加、拷贝感兴趣的各类数据库。 2. 创建新分子〔有四种方法〕 A ． 用 GenBank/GenPept, EMBL/SWISS-PROT and FASTA 、ASCII 等格式输入 DNA 或氨基酸。 B ．手 工 粘帖，然后保存到数据库中 C ． 从 其他 分子、接头、载体中剪切、拼接构键 D ． 从 DNA 或 RNA 分子的编码区翻译成蛋白质 3. 关于新分子的序列特征图谱：利用 GenBank/GenPept, EMBL/SWISS-PROT or FASTA 等 格式输入的分子都能显示出序列和结构图，但自己手工粘帖的没有，需要自己编辑 第一章 Chapter 1 Tutorial: Display Windows 〔显示窗口〕 目的：创建显示窗口，并对图、序列和文本进行操作 ? 1. 登录 Vector NTI 安装后首次登录，系统将提示是否允许填充空库，点 OK 。这样 DNA molecules, proteins, enzymes, oligos, and gel markers 将组成 NTI 的数据库。并出现以下两个窗口。 ? 2. 观察出现的 Vector NTI 工作窗口 和 Database Explorer 窗口 学习文档 仅供参考 上面的第一个窗口为工作窗口， 由菜单栏和工具条两栏， 移动鼠标到工具栏任意选项处， 鼠 标自动显示每个工具条的功能。 第二个窗口为 exlporing —— local vector NTI database, 显示的是上次打开的 DNA/RNA 或蛋白 分子。 3. Create a Display Window for pBR322 激活 exlporing —— local vector NTI database 窗口中的 DNA/RNA Molecules (MAIN) 数据库， 找到 pBR322 分子并双击打开。显示如下窗口： 学习文档 仅供参考 ? 4. 观察 pBR322 显示窗口 上面的窗口 由文本区〔对分子信息的文字描述，双击文件夹可以看到〕 、图形区〔标住限制 性内切酶位点等〕和序列区〔全序列及酶切位点〕三个部分组成。 ? 5. 显示窗口的管理〔通过拖拉标尺，改变窗口、或每个显示区的相对大小〕 ? 6. 转换 pBR322’s 图形区：在工具栏左边的 active pane 右侧有三个 按钮，用鼠标点当中那个〔 graphics pane 〕 ? 7. 对 pBR322’s 结构图进行操作： 用户可以尝试点击 、 、 ， 此时图形的大小会发生变化。选区设定：菜单 Edit —— set selection, 输 入 100bp –1000bp, 然后 OK. 可以看到选取在图形中用扇型框圈了起来 . 将 鼠标移到选取的 5 ’端 ,可以看到 ,通过拖拉可以延长或缩短选区范