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会计学;实验一. 提取小鼠肝脏组织的RNA;
一、真核细胞的总RNA
1、mRNA: 1-5%
5`鸟嘌呤7位甲基化—CH3修饰。
1)免受核酸酶破坏,
2)起始、促进蛋白质合成。
3`poly(A)尾巴结构 20--200个A. 翻译所必需。
起始密码:AUG
终止密码:UAA,UAG,UGA。
2、tRNA: 10-15%
3、rRNA: 80-85%
大亚基60S: 28S=4718nt 5S=120nt 5.8S=160nt
小亚基40S: 18S=1874nt;二、RNA提取的注意事项 ;1)发放口罩,帽子,每个组来一个人领取。
将1 mL Trizol 试剂移入Eppendorf管中。
2)实验教师操作:
取新鲜小鼠肝脏组织,组织块不宜过大,
放在玻片上立即研磨,研磨要彻底。
3)将研磨后的组织(小米粒大小)转移至1 mL Trizol 试剂中,盖紧盖,上下颠倒混合2 min以上。使组织细胞充分裂解。肉眼观察可见液体变成均匀浑浊状。
4)室温孵育10 min。;1、异硫氰酸胍法:
GuSCN 是一种强的蛋白质变性剂,能够裂解细胞的同时,还能有效地抑制内源性 Rnase的活性,通过有机溶剂的分步抽提,可获得纯度较高的细胞总RNA。 特点:需低温操作,但价格经济。
2、Trizol 试剂(商品化产品)
特点:在室温下可以提取细胞总RNA,
简单、快速、提取量大、纯度高。
3、mRNA提取试剂盒
真核细胞mRNA的3末端有ploy(A)尾,利用寡聚 dT纤维素结合mRNA,将其从细胞总RNA中分离出来。;RNase抑制剂;5)加入200 ?l氯仿,震荡混匀20-30 s,
室温放置5 min (此期间液体开始分层,不要轻易搅动液体)。
6)10000 rpm, 离心 5 min;8) 沉淀RNA:
加0.5 ml异丙醇,上下颠倒混匀,室温10 min。
10, 000?rpm,4?C,离心10 min.弃上清。
9) 加1ml 75%乙醇洗涤管壁。
(注意贴管壁在沉淀的对侧缓慢加入,不要搅动沉淀)
10) 7500rpm,4?C 离心 1 min,弃上清.
再离心几秒钟,
将管壁液体(用加样器)完全移净。;11)室温干燥3-5 min
(根据RNA沉淀大小决定,干燥后的沉淀应该是无色胶样透明状,避免过分干燥,此步骤非常关键。);12) RNA的溶解:用加样器吸取冰冷DEPC-H2O 13.5 ?l,加到RNA上,进行吹打溶解RNA 沉淀。溶解的RNA应置冰上保存。
13) 吸出 4.5 ?l溶液放到冰上备用 (将用于电泳).
14) 剩余 9 ?l溶液,放到冰上备用(将用于RT-PCR).;实验二. RNA 的琼脂糖凝胶电泳; 基本过程同DNA电泳一样,但应明确一点的是,因为RNA分子对RNA酶的作用非常敏感,因此必须用对RNA酶有抑制作用DEPC水来配置所有溶液,所有与RNA接触的仪器和装置都要严格处理以尽量减少RNA酶对样品的降解;
RNA样品: 4.5 ? l
上样缓冲液: 1 ? l
混匀后, 5.5 ? l 直接电泳上样(100伏,10-30分钟)
上样前预电泳5min。; RNA电泳结果 ; 分析本次实验结果:28S、 18S和5S的比例。;实验三:逆转录反应及PCR(RT-PCR);逆转录酶:
存在于逆转录病毒体内。 常见有哺乳动物型37oC,禽类型42oC 。
以mRNA为模板的DNA聚合酶,形成与RNA碱基相互补DNA链,后者称为互补DNA-cDNA。
RNAaseH的活性:切掉DNA和RNA杂合链上的
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