地塞米松应答通路检测与分析.pptVIP

College of Bioinformatics Science and Technology Harbin Medical University ?Jiankai Xu 问题的提出 药物的功效，是药物应答分子通路状态的最终体现。近年来，以通路为核心的研究，日趋成为药物研发的热点。 1）致病通路是药物治疗的新靶点。 2）药物应答通路的状态时联合用药的依据 3）药物应答通路分析提供了上市药物的新 用途。 问题的提出 目前通路分析工具并不十分适合用于药物应答的通路的分析。 其主要缺陷为： 1）多数以差异表达基因为计算对象，忽略 了应答通路内部的相关基因； 2）不考虑基因-基因信号作用的顺序； 3）应通路整体为研究对象，而忽略了其内 部具有具体功能（如促增殖、抑凋亡）的子路径。 问题的提出 因此，本研究拟以通路中从细胞膜到细胞核的具体功能子路径为研究对象，通过适宜的数学评价方法，建立检测和分析地塞米松应答通路状态。 * （1）子通路拆分 子通路定义 子通路拆分 子通路拆分 子通路数目 长度 平均长度 含有基因数目 87732 2-25 9.57 4179 子通路长度分布图 从子通路角度更清晰 地分析生物学状态 子通路中基因 高度冗余 （2）显著子通路鉴别