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- 2022-03-05 发布于浙江
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BIB-免费通用且详尽的计算抗体设计方案
IsAb
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作者|王玉杰 审稿|杨慧丹
本文介绍比兹堡大学药学院的Tianjian Liang等人在Briefings in Bioinformatic发表的文章“IsAb: a computational protocol for antibody design”,作者提出了治疗性抗体的in silico设计方案——IsAb,其结合了多种抗体工程技术,为计算抗体设计提供了通用且明确的指导,还提供了解决抗体设计中一些挑战的解决方案。为了验证IsAb,作者重新设计了D44.1抗体,并与之前的报道数据进行了比较,作者还以设计cemiplimab抗体为例展示了详细的工作流程,为未来的计算抗体设计带来了启示。
背景
抗体被广泛用于癌症、自身免疫性疾病等的免疫治疗,其在对抗如COVID-19等传染性病毒也发挥重要作用,具有巨大的治疗潜力,市场也在逐步扩大,因此抗体设计的发展必不可少。抗体再设计是抗体设计的重要方法之一,具有更容易修改抗体的特性,能更快地应用于临床的特点。抗体再设计的传统实验方法耗时耗力,计算方法成为辅助抗体设计的替代策略,但仍存在一些挑战,如抗体-抗原复合物的结合信息可能有限、某些抗原在与抗体相互作用时可能发生显著的构象变化,且大多数抗体设计工作
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