驱动蛋白的颈链结构与功能关系.pdfVIP

驱动蛋白的颈链结构与功能关系 摘要：驱动蛋白的颈链是驱动蛋白力产生的关键元件。颈链与驱动蛋白马达 结构域的对接过程为驱动蛋白沿着微管的向前运动提供了驱动力。驱动蛋白的颈 链由 14～18个氨基酸组成，它连接着马达结构域和由缠绕螺旋组成的茎部。颈 链与驱动蛋白马达结构域的对接过程是通过多种弱键相互作用实现的，这些弱键 相互作用多数都直接或间接与水分子有关。颈链及其相关区域的极为巧妙的氨基 酸结构使得这些弱键能够在细胞环境下有效地发挥作用。对颈链的结构与功能关 系的认识大大提高了我们对驱动蛋白运动机制的理解。 关键词：驱动蛋白；颈链；弱键作用 1驱动蛋白 基于微管运动的驱动蛋白超家族参与细胞内的物质运输、有丝分裂和减数分 裂、控制微管的动态特征和信号转导，并与许多神经类疾病相关，有着重要的医 学研究价值[l～3]。驱动蛋白通常被分成14个不同的家族，分别执行着不同的胞 内活动功能[4]。一般来说不同的驱动蛋白家族成员有高度保守的马达结构域， 但是有不同的颈链和尾部结构域，使其各自具有独特的货物约束力、不同的移动 速度、不同的运动方向和移动距离等。驱动蛋白可以单体存在，也可以二聚体、 四聚体存在，并且根据马达结构域的位置不同可以分为 N-端驱动蛋白、C-端驱 动蛋白或中间位置驱动蛋白[1～]]。本文着眼于N-端驱动蛋白介绍与其颈链相关 的当前研究进展。N-端驱动蛋白包括驱动蛋白家族中的 Kinesin-l、Kinesin-2、 Kinesin-3、Kinesin-5和Ki-nesin-7[2～4，8]。其中Kinesin-l是人们发现最早的驱 动蛋白，也是人们研究最多的驱动蛋白[9，10]，驱动蛋白在细胞内行走需要两 个头部密切配合，相互协调，这为分子生物力学研究提供了一个很好的模型。 2颈链的结构 颈链（neck linker）在驱动蛋白运动过程中起着至关重要的作用，它是研究 驱动蛋白力产生机制的关键元件 （见图1A）。不同驱动蛋白家族的颈链结构有所 不同，大约由14～18个氨基酸组成，连接着α6 和α7，其中α6 是马达结构域的 最后一个α 螺旋，α7 是缠绕螺旋的第一个α 螺旋。Hariharan[11]等通过晶体结构 序列分析和二级结构的预测分析两种方法对 Kinesin-l、Kinesin-2、Ki-nesin-3、 Kinesin-5和Kinesin-7五家族中颈链的氨基酸组成进行了分析。通过比较上述5 个家族中驱动蛋白的晶体结构确定，以α6 C-端的赖氨酸为颈链的起点，Kinesin-l 的颈链南14个氨基酸组成，Kinesin-2和Kinesin-3家族的颈链由17个氨基酸组 成，Kinesin-5和Kinesin-7家族的颈链由18个氨基酸组成，见表l。尽管许多驱 动蛋白家族的晶体结构已经被解析出来，但是文献中对于颈链的起点和终点却没 有一致的观点，也就是说哪里作为α6 的终点，哪里又是α7 的起点在文献中没有 得到统一。上述颈链的起始位置仅是一种观点或参考。研究表明驱动蛋白颈链区 域与马达N端的βo 发生相互作用，使驱动蛋白颈链部分与βo 形成有序的β 折 叠片构象，帮助颈链向马达头部对接[12]。值得一提的是，研究发现颈链较长的 家族，运动性反而较差，这虽然不是绝对的规律，但驱动蛋白家族在一定程度上 有这方面的倾向[11 。 3颈链的功能 驱动蛋白的功能主要有两个方面。首先驱动蛋白能够抵抗一定的阻力沿微管 向前行走，行走时处在前面的头部需要产生足够的力使后面的头部从微管蛋白上 分离，同时拖动负载向前运动。这个过程中驱动蛋白的颈链与马达结构域的对接 是驱动蛋白力产生机制的关键所在。这一过程已经被很多学者所关注，Rice等[14 在 1999年提出，驱动蛋白上连结马达结构域和马达茎区的颈链在马达沿微管向 前的运动上起重要的作用。Case等[15在2000年提出，对驱动蛋白颈链做突变， 会导致马达行动能力的丧失，并且马达头部与微管结合和与 ATP 结合的能力都 受到影响。Sindelar 等[16在 2002 年的研究成果显示，在马达头部结合了 ATP 的状态下颈链像“拉链”一样与马达头部对接的过程是使驱动蛋白前进的力产生 的步骤。2008年Karplus小组[17对驱动蛋白的颈链对接过程进行的分子动力学 模拟揭示出，马达头部N-端的β0对颈链对接的过程是非常重要的。驱动蛋白颈 链对接过程的拉链区域主要包括 β0、β3、Ll0、α4、L13、α6、β9 和 β10。按照 2KIN的氨基酸编号，主要涉及到的