分子遗传学遗传多态性.ppt

整理ppt 简单序列重复标记，SSR 又称微卫星DNA(Micro-satellite DNA)标记； 属高度重复序列，重复单元2~6bp，如(CA)n、(AT)、(GGC)n等重复，重复区大多几十~几百bp，分散在基因组中，大多不存在于编码序列内，具有较高的多态性。呈现孟德尔式遗传。目前微卫星DNA已经发现了２万余个位点。 TTCAGCTAGCTCAGCAGCAGCAGCAGCAGAGCTTGC AAGTCGATCGAGTCGTCGTCGTCGTCGTCTCGAACG 一个家系的微卫星PCR检测结果 SSR标记的主要特点 （1）数量丰富，广泛分布于整个基因组； （2）具有较多的等位性变异； （3）共显性标记，可鉴别出杂合子和纯合子； （4）实验重复性好，结果可靠； （5）由于创建新的标记时需知道重复序列两端的序列信息，因此其开发有一定困难，费用也较高。 微卫星DNA多态形成的机制 微卫星位点由其核心序列(core sequence)和两侧的侧翼序列(flanking sequence)共同构成,侧翼序列具有位点特异性,而微卫星本身的重复数变异则提供了微卫星位点产生多态性的基础.重复数越大,其变异性也越大,等位基因数也越多. 引起微卫星位点发生突变的原因主要为“滑链错配”（slipped-strand mispairing)。在DNA