代谢组学PPT精品文档.ppt

生物化学与分子生物学系 陈瑜; 代谢组学主要研究技术; Gene - mRNA - Protein - Metabolite;结构基因组学：研究生物系统的基因结构组成，即DNA的序列及其表达 。 蛋白组学：研究由生物系统表达的蛋白质及由外部刺激引起的差异 。 代谢组学：研究生物体系（细胞，组织或生物体）受外部刺激所产生的所有代谢产物的变化，是结构基因组学和蛋白组学的延伸 。;测序技术的进步，大规模基因组测序成为可能genomics 表达序列标签EST、微阵列、基因表达连续分析 SAGE，转录组学transcriptomics 生物体系中所有蛋白及其功能的蛋白组学proteomics 研究代谢产物的变化和代谢途径的代谢组学metabolomics; 转录组学和蛋白组学的局限性： 转录组学或蛋白组学上的变化不总能反映基因变更时在生化层面的表现型的改变。 现代技术对于转录组学和蛋白组学中mRNA以及蛋白质的识别是通过已知数据库进行序列比对的来实现的，因此识别和对比过程是间接的。 如果在缺乏某mRNA或蛋白质的数据信息时，以上的两种组学就只能为人们提供少量的信息。 ;基因组的变化不一定能够得到表达，从而并不一定对系统产生影响； 某些蛋白的浓度会由于外部条件的变化而升高，但由于这个蛋白可能不具备活性，从而也不对系统产生影响； 由于基因或蛋白的功能补偿作用，某个基因或蛋白的缺失会由于其他基因或蛋白的存在而得到补偿，最后反应的净结果为零； 小分子的产生和代谢才是这一系列事件的最终结果，它能够更准确的反映生物体系的状态。;代谢组学是继基因组学和蛋白质组学之后新近发展起来的一门学科，是系统生物学的重要组成部分。 基因组学和蛋白质组学分别从基因和蛋白质层面探寻生命的活动，而实际上细胞内许多生命活动是发生在代谢物层面的，如细胞信号释放，能量传递，细胞间通信等都是受代谢物调控的。 代谢组学正是研究代谢组（metabolome）——在某一时刻细胞内所有代谢物的集合——的一门学科。基因与蛋白质的表达紧密相连，而代谢物则更多地反映了细胞所处的环境，这又与细胞的营养状态，药物和环境污染物的作用，以及其它外界因素的影响密切相关。;与转录组学和蛋白质组学比较，代谢组学专门研究生物体系受外部刺激后所产生的所有代谢产物的变化，能够更准确地反映生物体系的状态，且位于系统生物学的最下游，是生物体系整体功能或状态最终结果的表现。 因此有人认为，“基因组学和蛋白质组学告诉你什么可能会发生，而代谢组学则告诉你什么确实发生了。”（Bill Lasley, UC Davis）;什么是代谢组学; Metabolomics 精髓是：对一个生物系统的细胞在给定时间和给定条件下所有小分子代谢物质的定量分析。 Metabolomics 着重研究的是单个细胞或细胞类型中所有的小分子成分和波动规律,或许可以叫做细胞代谢组学。多用于植物和微生物系统。 Metabonomics代谢组学是关于定量描述生物内源性代谢物质的整体及其对内因和外因变化应答规律的科学.?? 因此，Metabolomics可以译作代谢物组，Metabolomics是Metabonomics的一个组成部分.? ;代谢组学定义;代谢组是指一个细胞、组织或器官中所有代谢物的集合, 包含一系列不同化学型的分子, 比如肽、碳水化合物、脂类、核酸以及异源物质的催化产物等。代谢组学来源于代谢组一词,是研究一个细胞、组织或器官中所有小分子代谢组分集合的科学。 代谢组学研究的目的是定量分析一个生物系统内所有代谢物的含量。代谢组学分析可以指示细胞、组织或器官的生化状态, 协助阐释新基因或未知功能基因的功能, 并且可以揭示生物各代谢网络间的关联性, 帮助人们更系统地认识生物体。;代谢组学的发展;代谢组学的发展;代谢产物的分析层次;代谢组学的发展;代谢组学的特点： 1）关注内源化合物 2）对生物体系的小分子化合物进行定量定性研究 3）上述化合物的上调和下调指示了与疾病、毒性、基因修饰或环境因子的影响 4）上述内源性化合物的知识可以被用于疾病的诊断和药物筛选。; 代谢组学的优点： 1）基因和蛋白表达的有效的微小变化会在代谢物上得到放大，从而使检测更容易； 2）代谢组学的技术不需建立全基因组测序及大量表达序列标签（EST）的数据库； 3）代谢物的种类要远小于基因和蛋白的数目，每个生物体中代谢产物大约在103数量级，细菌基因组中几千个基因； 4）因为代谢产物在各个生物体系中都是类似的，所以代谢组学研究中采用的技术更通用；; 代谢组学的局限性;研究方法;代谢组学的技术平台;代谢组学主要研究技术;代谢物组学研究有样品预处理、数据采集和数据分析解释三个阶段，以高通量的检测实验和