《基因组学》课程教学大纲（本科）.pdfVIP

基因组学 （Genomics） 课程代码 学分：2 学时：32 （其中：讲课学时：32 上机学时：0 课外学时: 0） 先修课程：生物化学，细胞生物学，遗传学，分子生物学 适用专业：生物技术 教 ：《基因组 3》；T.A. Brown 著，袁建刚等译；科学出版社，2009/3/ 1 第 1 版 一、课程性质与课程目标 （一）课程性质 本课程是一门对专业基础课程拓展的选修课，通过对基因组学的课程学习，使学生掌握基因组 学的基本概念、基本原理和基本方法，了解该学科重点研究领域以及研究现状与进展，夯实相关课 程学习与专业化发展的基础，奠定从事与生物科学相关的研究和实际工作的理论基础，有利于开拓 学生视野，提高学生全面思维和和综合分析能力。 （二）课程目标 课程 目标1：掌握基因组的基础知识与相关技术方法和策略，并对学科发展前沿有所了解，奠 定后续课程的学习或从事与生物科学相关的研究和实际工作的理论基础。 课程 目标2：通过课堂学习掌握一定的思维方法和分析能力，能够运用已有知识给出解决问题 的思路和方案。 二、课程内容与教学要求 绪论 （一）课程内容 （1）基因组学的产生、发展与热点 （2）基因组学、生物信息学与当代生命科学 （二）教学要求 （1）基因组学的产生、发展与热点——掌握、理解 （2）基因组学、生物信息学与当代生命科学——了解 （三）重点与难点 1. 重点 基因组学产生时代背景与该学科在现代生命科学中的任务 2. 难点 从单个基因功到以“组学”研究基因组的结构与功能的理解 第一章 基因组作图 （一）课程内容 （1）遗传图谱 （2）物理图谱 （3）基因组文库 （二）教学要求 （1）遗传图谱——掌握、理解 （2）物理图谱——掌握、理解 （3）基因组文库——掌握、理解 （三）重点与难点 1.重点 结构基因组的手段与方法 2.难点 遗传图与物理图的整合对基因组测序的指导作用 第二章 基因组测序与组装 （一）课程内容 （1）DNA 测序与基因组测序战略 （2）DNA 序列的组装 （3）以实例介绍基因组计划战略 (人类基因组计划或水稻基因组计划) （二）教学要求（将相关内容按照掌握、理解、了解等不同教学要求进行分类） （1）DNA 测序与基因组测序战略——掌握、理解 （2）DNA 序列的组装——掌握、理解 （3）以实例介绍基因组计划战略——了解 （三）重点与难点 1.重点 基因组测序的策略 2.难点 基因组序列的组装 第三章 基因组序列的诠释 （一）课程内容 （1）辨认基因与注释基因 （2）辨认调控序列与注释 （3）以实例介绍基因组信息的诠释 (酿酒酵母、人类或拟南芥举例) （二）教学要求（将相关内容按照掌握、理解、了解等不同教学要求进行分类） （1）辨认基因与注释基因——掌握、理解 （2）辨认调控序列与注释——掌握、理解 （3）以实例介绍基因组信息的诠释——了解 （三）重点与难点 1.重点 注释基因的手段与生物信息学的关系 2.难点 注释基因的生物信息学手段的理解 第四章 基因组结构 （一）课程内容 （1）真核生物核基因组 （2）原核生物基因组 （3）真核生物细胞器基因组 （4）噬菌体和真核生物病毒的基因组 （二）教学要求 （1）真核生物核基因组——了解、理解 （2）原核生物基因组——了解、理解 （3）真核生物细胞器基因组——了解、理解 （4）噬菌体和真核生物病毒的基因组——了解、理解 （三）重点与难点 1.重点 真核生物基因组结构特点 2.难点 系统的认识病毒、细菌及真核生基因组结构特点与进化的关系 第五章 全面认识基因功能 （一）课程内容 （1）cDNA 文库技术 （2）突变体库、基因敲除、RNAi 与 TILLING （3 ）转录组、蛋白质组与代谢组 （二）教学要求 （1）cDNA 文库技术——掌握、理解 （2）突变体库、基因敲除、RNAi 与 TIL