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二、鉴定克隆疾病相关基因需要多学科多途径的综合策略 疾病相关基因鉴定克隆策略示意图 三、确定候选基因是多种克隆疾病相关基因方法的交汇 有许多途经能够达到最终鉴定疾病相关基因的目的，这些方法最终将交汇在候选基因上。一旦候选基因被鉴定，即可筛检患者中该基因的突变。候选基因可不依赖其在染色体位置而予以鉴定，但常用的策略仍然是首先找出候选染色体区域，然后在此区域内鉴定候选基因。 第二节 疾病相关基因克隆的策略和方法 一、不依赖染色体定位的疾病相关基因克隆策略 不依赖染色体定位的疾病相关基因克隆策略包括功能克隆、表型克隆及采用位点非依赖的DNA序列信息和动物模型来鉴定和克隆疾病基因。 （一）从已知蛋白质的功能和结构出发克隆疾病基因 功能克隆（functional cloning）采用的是从蛋白质到DNA的研究路线，针对的是一些对影响疾病的功能蛋白具有一定了解的疾病 1．依据蛋白质的氨基酸序列信息鉴定克隆疾病相关基因 2．用蛋白质的特异性抗体鉴定疾病基因 （二）从疾病的表型差异出发发现疾病相关基因 表型克隆（phenotype cloning）基于对疾病表型和基因结构或基因表达的特征联系已经有所认识的基础上来分离鉴定疾病相关基因 1. 从疾病的表型出发，比较患者基因组DNA与正常人基因组DNA的不同，直接对产生变异的DNA片段进行克隆，而不需要基因的染色体位置或基因产物的其他信息。 2. 针对已知基因。如果高度怀疑某种疾病是由于某个特殊的已知基因所致，可通过比较患者和正常对照间该基因表达的差异来确定该基因是否为该疾病相关基因。 3. 针对未知基因的，可通过比较疾病和正常组织中的所有mRNA的表达种类和含量间的差异，从而克隆疾病相关基因。这种差异可能源于基因结构改变，也可能源于表达调控机制的改变。 依据DNA或mRNA的改变与疾病表型的关系，可有几种策略： 针对未知基因常用的技术有 mRNA差异显示（mRNA differential display，mRNA-DD） 抑制消减杂交（suppressive substractive hybridization，SSH） 基因表达系列分析（SAGE） cDNA微阵列 （cDNA microarray） 基因鉴定集成法 （integrated procedure for gene identification） 目录 第二章 疾病的基本知识 第一节 疾病的发生与发展 疾病定义: 由致病因素作用于机体,使机体的生命活动受到干扰和破坏的现象. 一、引起水产动物疾病的原因和条件 （一）引起水产动物疾病的环境因素 1、生物因素 2、水的理化因素 （1）水温 （2）溶氧量 （3）pH值 （4）盐度 （5）水体化学成分和有毒物质 3、人为因素 （1）放养密度不当和混养比例不合理 （2）饲养管理不当 （3）机械损伤 （二）影响水产动物疾病的内在因素 与水产动物的种类、大小、年龄、性别和健康状况等有密切关系 病原、环境和宿主之间的关系 宿主 环 境 病原 亚健康 亚健康 发病 二、疾病的种类 （一）按病原划分 1、由生物引起的疾病 （1）微生物病 包括病毒、细菌、真菌和单细胞藻类等病原体引起的疾病。 （2）寄生虫病 包括原生动物、单殖吸虫、复殖吸虫、线虫、棘头虫、蛭类、钩介幼虫、甲壳动物等病原体引的疾病。 （3）有害生物引起的中毒 包括微囊藻、三毛金藻和赤潮等引起的中毒。 （4）生物敌害 包括水生昆虫、水螅、水蛇、水鸟、水鼠、凶猛鱼类、贝类等造成的危害。 2、由非生物引起的疾病 （1）机械损伤 如擦伤、碰伤等。 （2）物理刺激 如感冒、冻伤等。 （3）化学刺激 如农药、重金属盐中毒等。 （4）由水质不良引起的疾病 如泛池、气泡病、畸形等。 （5）由营养不良引起的疾病 如饥饿、营养不良等。 （二）按养殖水体划分 1、海水动物疾病。 2、淡水动物疾病按患病对象划分。 （三）按养殖动物的不同分 1、鱼类的疾病 2、虾蟹类疾病 3、贝类疾病 4、两栖类疾病 5、爬行类疾病 6、棘皮动物疾病 （四）按感染的情况划 1、单纯感染 由一种病原体感染所引起的疾病。如草鱼病毒性出血病，其感染的病原体往往只有一种草鱼呼肠孤病毒。 2、混合感染 由两种或两种以上的病原体混合感染所引起的疾病。如草鱼烂鳃、赤皮、肠炎“老三病”并发症，是由柱状曲桡杆菌、肠型点状产气单胞杆菌和荧光假单胞杆菌三种病菌同时感染而引起的疾病。 3、原发性感染 病原体感染健康机体使之发病。如健康草鱼感染呼肠孤病毒而患病毒性出血病。 4、继发性感染 已发病的机体，因抵抗力降低而