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真核微生物狭义上指原生生物, 广义上还包括单细胞真菌和微型后生动物[1-3], 其种类繁多、分布广泛, 在海洋初级生产、微食物网和生物地球化学循环等生态过程中发挥着重要作用[4-5]。海洋真核微生物多样性的研究对于理解海洋生态环境的变化过程以及人类活动和气候变化对海洋生态系统的影响等至关重要。
近年来, 环境DNA结合高通量测序技术被广泛应用于真核微生物多样性研究中[6-8], 极大地拓展了对真核微生物多样性及其分布的认知, 检获了大量潜在新类群, 并为微型生物地理分布这一国际热点争论, 提供了大量新鲜素材和佐证[9-14]。近海因陆源输入[15-17]等原因具有丰富的营养盐, 真核微生物丰度
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