《分子标记技术》.ppt

分子标记技术 Molecular Marker Technology 分子标记技术课程安排 一、分子标记技术概述 (3) 二、DNA的提取、PCR优化与克隆 (3) 三、显性分子标记技术 (ISSR、AFLP) (6) 四、共显性分子标记技术(RFLP、SSR) (6) 五、分子标记数据的读取方法与分析 (3) 六、序列测定与分析 (3) 文献讨论 (6-12) 周延清(编著). 2005. DNA分子标记技术在植物研究中的应用. 北京：化学工业出版社 郑成木主编. 2003. 植物分子标记原理与方法. 长沙：湖南科学技术出版社 邹喻苹,葛颂,王晓东等.2001.系统与进化植物学中的分子标记.北京:科学出版社 Caetano-Anolles G Gresshoff P M (eds) . 1998. DNA Markers: Protocols, Applications, and Overviews. New York: Wiley-Vch Press. 王中仁. 1996. 植物等位酶分析. 北京：科学出版社 参 考 资 料 一、分子标记技术概述 遗传标记 (genetic markers) 形态标记 (morphological markers) 细胞学标记 (cytological markers) 生物化学标记 (biochemical markers) 分子标记 (molecular markers) 形态标记 Color: yellow vs white etc Texture: smooth vs rough etc Shape: round vs irregular etc 遗传标记原用于遗传作图，确定染色体上基因顺序（gene mapping） 1913年，Alfred H. Sturtevant 使用六个形态标记构建了第一个果蝇遗传图谱 1923年，Karl Sex发现菜豆数量性状（种子颜色和大小）和数量性状位点之间的遗传连锁 （QTL） 细胞学标记 核型分析 (karyotype analysis) 染色体显带 (chromosome banding) 生物化学标记 同工酶(isozyme)：电泳所可区分的同一种酶（系统）的不同变化 等位酶(allozyme)：由一个位点的不同等位基因编码的同种酶的不同类型，其功能相同但氨基酸序列不同 分子标记 或蛋白质序列（大小） (狭义的) 指基于DNA分子序列的标记 (广义的) 指可遗传的、且可检测到的DNA序列 是以生物大分子的多态性为基础的一种遗传标记 分子标记是能反映生物个体或种群间基因组中某些差异特征的DNA片段 分子标记（molecular marker）技术产生的原因：（形态性状的局限） 基于形态的遗传标记（形态标记）发展到同工酶又到DNA分子标记 DNA分子标记在分子生物学的发展过程中诞生和发展，它能够直接反映基因组DNA间的差异 * DNA或cDNA等分子水平上的多态性检测技术 * 能提供分子标记的分子生物学技术 分子标记技术 First Generation: 1980s -Based on DNA-DNA hybridizations, such as RFLP. Second Generation: 1990s -Based on PCR: Using random primers: RAPD, DAF, ISSR. Using specific primers: SSR, SCAR, STS -Based on PCR and restriction cutting: AFLP, CAPs. Third Generation: recently -Based on DNA point mutations (SNP), can be detected by SSCP, DNA chip, sequencing etc. 酶切扩增多态性序列（Cleaved Amplified Polymorp