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功能基因研究套路 实战项目 ·写作培训 ◼ 从文献到实操的演练 上海尤里卡信息科技有限公司 版权所有 Materials and methods Results 机制研究 简介（1 ） ➢ 本项目中，机制研究的实验涉及两个部分： ✓ 第一部分：信号通路筛选与验证 • 目的： • 明确靶标基因对肿瘤细胞表型调控的信号通路 • 实验分为两步： • GSEA预测信号通路 • WB验证通路中关键分子的表达 • 结果： • GSEA ：与基因表达相关的信号通路，如右图A （可能没有阳性，即预测的结果实验没有验证 出来，则此图省略） • WB结果，印迹图（右图B ）和灰度统计图（右 图C ，也可以只show印迹图，而不做灰度分析 图1. CBX2对MAPK信号通路的调控。A. GSEA富集结果提示，CBX2的表达与MAPK通路基因表达正相关； B-C. WB检测MAPK关键基因的表达。 和统计） GSEA的原理和数据解读，可查看 《功能基因套路课》视频，第2章第1节 《文献实验背景知识》00:05:45-00:27:09 GSEA分析的数据可以有两部分，一是提示与基因表达相关的表型，二是与基因表达相关的信号通路 解 螺 旋 | 陪 伴 医 生 科 研 成 长 示例数据来源于文献或虚拟数据，仅用于示范 Results 机制研究 简介（2 ） ➢ 本项目中，机制研究的实验涉及两个部分： ✓ 第二部分：信号通路的Rescue实验 • 目的： • 验证基因对信号通路的调控。 • 实验分为两部分： • 表型验证 • 加入通路抑制剂或激活剂，看是否可以已转基因的作 用。如靶标基因通过激活MAPK信号通路促进肿瘤增 殖，则在过表达靶标基因的细胞中加入MAPK信号通 路抑制剂，检测细胞增殖能力的变化 • 通路中关键分子的表达 • 结果： • 表型检测（以增殖为例，图2A ） • WB检测基因蛋白水平的变化（图2B ） ✓ 这两部分在写作时可以合并在同一个标题下，也可以分成两个半标题写 图2. CBX2通过MAPK信号通路调控细胞增殖。MAPK抑制剂处理过表 达CBX2的乳腺癌细胞后，细胞增殖（A ）、周期（B ）、凋亡（C ）以 及MAPK通路分子（D ）的变化。 图1和图2也可以合并成一张图 解 螺 旋 | 陪 伴 医 生 科 研 成 长 示例数据来源于文献或虚拟数据，仅用于示范 Materials and methods 机制研究 Materials and methods中机制研究实验--写作 由于机制研究涉及的表型检测和信号通路检测所用的实验与细胞实验相同，在此前已经写过，因此不需要再重复写。只需要在Figure legend里或者在结果描述 里描述一下信号通路Rescue实验中使用抑制剂/激活剂处理细胞的操作即可（交代一下使用的抑制剂/激动