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- 2023-01-17 发布于四川
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知无不研”|一文读懂染色质免疫共沉淀技术(Chip )
染色质免疫共沉淀技术(Chip )
基于体内分析而进展的染色质免疫沉淀分析(Chromatin immunoprecipitation assay kit,ChIP )技术可以真实、完整地反映结合在DNA序列上的调控蛋白。由于ChIP采纳甲醛固定活 细胞或者组织的方法,因此能比较真实的反映细胞内TF与Promoter的结合状况,还可以用来讨论 组蛋白的各种共价修饰与基因表达的关系。近年来,这种技术得到不断的进展和完善。采纳结合微阵 列技术在染色体基因表达调控区域检查染色体活性,是深化分析癌症、心血管病以及中心神经系统紊 乱等疾病主要通路的一种特别有效的工具。
染色质免疫沉淀分析(ChIP )的基本原理是在活细胞状态下,当用甲醛处理时,相互靠近的 蛋白与蛋白、蛋白与核酸(DNA或RNA )之间会产生共价犍。细胞内,当TF与Promoter相互结 合时,它们必定靠的比较近或者契合在一起,这个时候用甲醛处理,能使它们之间产生共价键。固定 的蛋白质?DNA复合物通过超声或酶处理将其随机切断为肯定长度范围内的染色质小片段,然后通 过抗原抗体的特异性识别反应沉淀此复合体,特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段,通过对目的 片断的纯化与检测,从而获得蛋白质与DNA相互作用的信息。通过qPCR或二代测序,筛选与目的 蛋白互作的未知DNA信息。
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