北京大学化学信息学course三维结构的实验数据资源基于三维结构的计算方法.pptxVIP

会计学1北京大学化学信息学course三维结构的实验数据资源基于三维结构的计算方法 2剑桥晶体结构数据库（CSD）有机物、有机金属和金属复合物二维结构/三维结构晶体学数据（空间群、晶胞参数）、X-ray/neutron 衍射数据等参考文献第1页/共40页 3蛋白质数据库: PDB大于10,000个大分子三维结构包括蛋白质、碳水化合物、DNA、DNA/蛋白复合物X-ray/Neutron衍射、NMR、结构计算第2页/共40页 4其它非实验数据计算得到的三维结构数据库商用化合物库CABeilstenCMCACD-3D开放数据库和专有数据库NCI第3页/共40页 5其它非实验数据计算得到的三维结构数据库专业数据库天然产物DNPNAPALERT代谢库Metabolite 毒性库Toxicity 药物分子库MDDR-3DWDIACD-3D数据库查询结果浏览界面第4页/共40页 6计算机辅助药物设计的一般过程ACDCSDMDDRNIH中草药数据库(CHDD)构效关系模型计算组合化学优化 理想活性化合物a.原子生长法b.片段生长法c.模片裁剪法d.分子对接法数据库搜索a.构象搜索b.构象迭合c.药效团识别 药效团 QSAR先导化合物 合成 测活具有相同作用机制的系列化合物受体数据库 (PDB等)受体模型.复合物结构c.分子对接b.残基突变d.共振识别活性位点或结合位点计算机辅助药物设计的一般过