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基于转录组及代谢组探讨中国绿水螅宿主及
共生藻对饥饿胁迫的分子响应
摘要
单细胞绿藻在水螅体内共生是一种独特的生物学现象,在细胞生物学、
免疫学及分子生物学等领域具有较高的研究价值。共生藻提供部分光合作
用产物给水螅细胞作为其营养补充是水螅-单细胞绿藻共生体宿主与共生
藻共生关系维系的基础,同时宿主细胞作为共生藻的庇护所 (避免被其他
水生动物捕食)、也为共生藻提供其生命活动需要的碳源和氮源。尽管水
螅-单细胞绿藻共生体中宿主与共生藻间共生关系的生物学意义已较为明
确,但还有涉及宿主水螅与共生藻间分子互作及共生机制的诸多疑问依然
待解:水螅本来是以水生小型节肢动物为食物的典型 “肉食性”动物,而
特殊情况下如食物缺乏时其维持基本生命活动的营养物质为来自共生藻
的光合作用产物 (糖类物质为主)、即相当于水螅临时转变为 “素食性”
动物,那水螅细胞内主要代谢途径及代谢调控机制是否转变为适合消化和
利用糖类物质的类型?共生藻是直接把光合作用产物传递给动物宿主细
胞?还是把一部分光合作用产物转换成其他形式的物质后再传递给宿主
细胞?目前研究这些复杂代谢问题的一个比较好的切入点是尝试运用比
较组学方法。
中国绿水螅 (Hydrasinensis)是一种典型的刺胞动物-单细胞绿藻共生
体系,由于其具有身体结构简单、无性繁殖速率高及易在实验室条件下大
规模培养等优点,已成为动物-微藻共生体研究的重要模式体系。基于此,
本研究首先把经饥饿胁迫处理4 周后的中国绿水螅的水螅组织和共生藻两
个组分分离纯化,再分别对喂食组 (对照组)共生藻与饥饿组共生藻间转
录组、喂食组水螅组织与饥饿组水螅组织间转录组、喂食组共生藻与饥饿
组共生藻间代谢组以及喂食组水螅组织与饥饿组水螅组织间代谢组进行
了比较研究,主要研究结果总结如下:
1. 绿水螅的共生藻对饥饿胁迫响应的转录组分析
高通量测序共获得原始测序数据19.62G,拼接后共获得28407条
。饥饿组与喂食组共生藻间共筛选到 个差异表达基因,其中
Unigene 1564 915
个表达上调,649个表达下调。基于差异表达基因通过KEEG分析共富集到
了90个代谢通路,其中包含16个糖类代谢(Carbohydratemetabolism)通路、
个脂类代谢( )通路、 个含氮类物质代谢(
14 Lipidmetabolism 15 Nitrogenous
I
compoundmetabolism)通路、6个能量代谢 (Energymetabolism)通路及1
个ABC转运蛋白体系 (ABCtransporter)。另外,还富集到了3个信号通路
和 个与抗氧化作用相关的通路,包括过氧化物酶体 ( )、谷胱
11 Peroxisome
甘肽代谢(Glutathionemetabolism)通路及类胡萝 卜素生物合成(Carotenoid
biosynthesis)通路等。按富集显著性排序的前20个代谢通路中主要包含了4
个糖类代谢通路, 个脂类代谢通路, 个含氮类物质代谢通路, 个能量
2 1 3
代谢通路及2个抗氧化相关通路。
2. 绿水螅的水螅组织对饥饿胁迫响应的转录组分析
高通量测序共获得原始测序数据25.12G,拼接后共获得52523条
Unigene。饥饿组与喂食组水螅组织间总共筛选到7684个差异表达基因,其
中6700个表达上调,984个表达下调。基于差异表达基因通过KEEG分析共
富集到了 个代谢通路,其中包含 个糖类代谢通路、 个脂类代谢通
321 24 25
路、20个含氮类物质代谢通路及1个
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