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数据预处理第4篇:数据预处理(sklearn插补缺失值)
由于各种原因,现实世界中的许多数据集都包含缺失值,通常把缺失值编码为空⽩,NaN或其他占位
符。但是,此类数据集与scikit-learn估计器不兼容,这是因为scikit-learn的估计器假定数组中的所有值都
是数字,并且都存在有价值的含义。如果必须使⽤不完整数据集,那么处理缺失数据的基本策略是丢弃
包含缺失值的整个⾏和/或列,但是,这是以丢失有价值的数据为代价的(即使数据不完整),更好的策
略是估算缺失值,从数据的已知部分推断出缺失值,这就是插补(imputation)。
单变量插补法(univariate imputation ),仅使⽤第i个特征维度中的⾮缺失值来插补第i个特征维度中的
值。相⽐之下,多变量插补算法(multivariate imputation )会使⽤整个可⽤特征维度集来估算缺失值。
⼀,单变量插补
在sklearn包中,使⽤估算器来实现单变量插补,单变量插补的处理策略(由strategy参数制定)有四个:
mean ,median ,most_frequent和constant (搭配fill_value参数使⽤)。其中,mean和median分别表⽰使⽤
均值和中位数来插补缺失值;对于定性数据,可以使⽤
most_frequent (众数)来插补缺失值。
import numpy as np
from sklearn.impute import SimpleImputer
imp = SimpleImputer(missing_values=np.nan, strategy=mean)
imp.fit([[1, 2], [np.nan, 3], [7, 6]])
SimpleImputer()
X = [[np.nan, 2], [6, np.nan], [7, 6]]
print(imp.transform(X))
[[4. 2. ]
[6. 3.666...]
[7. 6. ]]
⼆,多变量插补
在scikit-learn包中,多变量插补使⽤估算器来实现,该估算器把含有缺失值的每个特征建模为其他特征
的函数,并使⽤该估算值进⾏插补。
多变量插补法以迭代循环的⽅式进⾏:
在每个步骤中,将特征列指定为输出y ,将其他特征列视为输⼊X。
把回归器拟合到已知的y的(X ,y )上。
然后,使⽤回归器预测y的缺失值。
针对每个特征以迭代⽅式完成此操作,然后在max_iter插补回合中重复此操作。
返回最后⼀轮估算的结果。
注意:多变量插补估算器⽬前仍处于试验阶段:默认参数或⾏为可能会更改。解决以下问题将有助于稳
定IterativeImputer :
收敛标准():IterativeImputer不会收敛,事实上,收敛准则似乎不会随着迭代⽽下降。
默认估计量():使⽤正则化最⼩⼆乘模型进⾏迭代插补与使⽤NMF进⾏插补⼤致相同。取⽽代之的
是,⾄少在sample_posterior = False的情况下,否则,我们应该使⽤RandomForestRegressor作为
IterativeImputer中的默认回归器。
随机状态的使⽤ () :通过random_state指定RandomState对象,来保证结果可重复,有些跟scikit-learn相兼
容的模块可能不兼容RandomState对象。
要使⽤多变量插补,需要显式导⼊enable_iterative_imputer。
import numpy as np
from sklearn.experimental import enable_iterative_imputer
from sklearn.impute import IterativeImputer
imp = IterativeImputer(max_iter=10, random_state=0)
imp.fit([[1, 2], [3, 6], [4, 8], [np.nan, 3], [7, np.nan]])
IterativeImputer(random_state=0)
X_test = [[np.nan, 2], [6, np.nan], [np.nan, 6]]
# the model learns that the second feature is double the first
print(np.round(imp.transform(X_test)))
[[ 1. 2.]
[ 6. 1
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