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畜牧渔业 7篇
内容提要:
? 线鳞型 鲫(框鳞镜鲤♀×红鲫♂)mtDNA及同工酶的遗传分析
? 从固定液保存的刺参样品中提取基因组DNA的改进方法
? 牛片形吸虫病的流行、诊断与治疗
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全文共16515 字
线鳞型 鲫(框鳞镜鲤♀×红鲫♂)mtDNA及同工酶的遗传分析
【摘 要】对全鳞型 鲫和线鳞型 鲫的mtDNA D-loop及其邻近区段进行PCR扩增并测序,并检测了两种类型 鲫肌肉的GPI和LDH同工酶。1尾 鲫(全鳞型)获得了碱基排列顺序清晰的1348 bp的片段,2尾 鲫(全鳞型)尾为1351 bp,3尾 鲫(均为线鳞型)为1349 bp。应用MEGA6.0软件与GenBank上的3个鲤鱼(KC292935、KC292936和X61010.1)和3个鲫鱼(KC292946、KC292947和KC292948)相应区段比较结果表明,6尾 鲫与鲤鱼和鲫鱼的遗传距分别为0.011和0.095,鲤鱼与鲫鱼的遗传距为0.097。GPI与LDH两种同工酶谱显示两种类型 鲫均具有来自鲤鲫双方的遗传物质。结果表明,全鳞型与线鳞型 鲫均符合母本为鲤鱼、父本为鲫鱼的遗传特征,推测线鳞型 鲫母本鳞被的基因型应为SSNn、SsNn或ssNn,父本应为SSnn,线鳞型 鲫鳞被的基因型应为SSNn或SsNn。
关键词: 鲫;鳞被;基因型;mtDNA;碱基序列;同工酶
项目: 科技基础条件平台:水产种质资源平台(2014DKA30470);天津市星火计划项日“ 鲫良种繁育及健康养殖技术示范”(09ZHXHNC05100); 星火计划项日“ 鲫工厂化育苗及健康养殖技术示范”(2010GA610007);天津市农业科技示范推广项日“ 鲫良种繁育及健康养殖技术推广”(201001010); 级科技计划项日“水产品健康养殖、加工与质量安个控制产业化示范”(2013G A610003)。
通讯
鲫为 级天津市换新水产良种场培育的以框鳞镜鲤为母本、红鲫为父本的杂交种,2007年被 认定为养殖新品种(品种登记号:GS02-001-2007)。鱼体背部及两侧呈浅黄色,腹部银灰色,体被全鳞,鳞片中等大小,侧线鳞31~34枚[1-2]。2013年11月份在天津市两个养殖场养殖的 鲫中发现有线鳞型个体(90尾中有6尾线鳞型个体,占6.67%)。
鲤鱼中依据鳞被特征可以分为鳞鲤(scaled carp)、线鳞镜鲤(linear mirror carp)、散鳞镜鲤(scattered mirror carp)和革鲤(leather carp)或裸鲤(nude carp)共四种类型,其中线鳞镜鲤和裸鲤均含有N基因,而楼允东认为在我国用于杂交的鲤鱼品种不包括线鳞镜鲤和革鲤[3-4]。至今在我国鲤鲫杂交子代中没有 线鳞型个体的报导。mtDNA为母性遗传,其D-loop以及COⅠ等区段的序列分析可以作为种类鉴别的DNA条形码[5-10]。同工酶可以有效鉴别鲤鲫杂交种[11-14]。
为探讨线鳞型个体是否属于 鲫,是否具有 鲫的遗传结构,鳞被遗传特点如何,本研究以3尾全鳞型 鲫以及3尾线鳞型个体(以下也称为 鲫)为实验材料进行了mtDNA D-loop及其邻近区段的PCR扩增和序列测定,与GenBank上的鲤鱼、鲫鱼的相应区段进行了序列比较。同时检测了两种类型 鲫肌肉的GPI和LDH同工酶。以期为 鲫的种质鉴定以及鲤、鲫鱼遗传育种工作提供依据。
1材料与方法
1.1试验鱼
于2013年11月从天津市某鱼类养殖场采集3尾全鳞型 鲫以及3尾线鳞型 鲫(图1、表1)。鲜活状态下剪取大小约1.0 cm×0.5 cm的鳍条用于DNA提取,-20 ℃冷冻保存鱼体用于同工酶的检测。
1.2DNA的提取、mtDNA D-loop及邻近区段PCR扩增
用苯酚-氯仿抽提法从鳍条提取总基因组DNA,4 ℃下保存备用[15]。以提取的DNA为模板,使用L15923和H1067引物对每尾试验鱼的mtDNA D-loop及其邻近区段进行扩增,两个引物的结合位点分别位于tRNAThr和12S rRNA 编码区上。将PCR产物委托深圳华大基因科技有限公司纯化并测序,得到的序列依据峰图进行确认[9]。
1.3DNA序列分析
使用MEGA6.0软件对6个 鲫序列、GenBank上的3个鲤鱼序列(KC292935、KC292936和X61010.1)和3个鲫鱼序列(KC292946、KC292947和KC292948)进行比对分析,计算6尾 鲫与鲤鱼、鲫鱼的遗传距,构建NJ树[16]。
1.4同工酶电泳
使用水平式淀粉凝胶电泳法(缓冲液为C-AP
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