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- 2023-05-01 发布于广东
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P-value: 学生分布 1. 一般选择双尾分布 2. 异方差双样本检验 3. Excel函数:=TTEST(B2:D2,E2:G2,2,3) 4. C:对照组;T:实验组 C1 C2 C3 T1 T2 T3 TTEST Gene 1 1.322 1.676 1.457 3.526 4.234 3.879 0.001988 现在是31页\一共有55页\编辑于星期四 Multiple Comparisons 1. 在基因芯片的实验中,每一个基因/探针,都是一个独立的实验 2. 基因芯片:高通量,1,000个基因/探针 3. 因此,无论怎么比较,总会有一些基因会是统计显著性差异表的 —— 可能是随机产生的 4. 如何评估表达差异基因预测的有效性? 5. 例:1,000个探针的双通道芯片,以p-value 0.01为域值,发现7个上调基因,5个下调基因,分析结果是否具有统计学意义? 现在是32页\一共有55页\编辑于星期四 False Discovery Rate (FDR) 1. False positive prediction: “Type 1 error or False Discovery 2. False Discovey Rate (FDR) = p-value * No. of Genes 上例: FDR= 0.01* 1,000=10 (随机) 7个上调基因,5个
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