病毒基因组鉴定和拼接的方法及应用.pdfVIP

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2023-05-09 发布于四川
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病毒基因组鉴定和拼接的方法及应用.pdf

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本发明提供了一种病毒基因组鉴定和拼接的方法及应用。该方法包括：对于原始数据进行前处理。将高质量reads拼接为初始重叠群。以初始重叠群作为查询序列，对待鉴定病毒的蛋白序列做同源性搜索，得到潜在病毒重叠群。以潜在病毒重叠群作为查询序列在NCBINR库中进行同源性搜索，保留潜在病毒重叠群中的最佳比对属于病毒的查询重叠群，作为目标病毒重叠群，并得到与目标病毒重叠群对应的最佳比对的病毒物种。从参考病毒基因组序列库中选择最佳比对的病毒物种所对应的参考基因组，对高质量reads进行拼接，得到待鉴定病毒的病

(19)国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 116072222 A (43)申请公布日 2023.05.05 (21)申请号 202310123384.5 (22)申请日 2023.02.16 (71)申请人湖南大学地址 410000