《水产动物线粒体DNA序列遗传多样性分析操作规程》编制说明.pdfVIP

广西团体标准《水产动物线粒体DNA 序列遗传多样性分析操作规程》（征 求意见稿）编制说明 广西壮族自治区水产科学研究院 一、工作简况 （一）任务来源 为规范水产动物线粒体DNA 序列遗传多样性分析操作，促进对遗传资源的科学研究和开 发利用，加强珍稀濒危野生水产动物资源的保护，在完成广西创新驱动发展专项资金项目《广 西主导（特色）水产种质资源的收集、评价与鉴定》的基础上，本单位提出《水产动物线粒体 DNA 序列遗传多样性分析操作规程》的编写要求。 （二）起草单位 本标准由广西壮族自治区水产科学研究院负责起草。 （三）主要起草人 本标准主要起草人：彭敏、杨春玲、陈秀荔、曾地刚、朱威霖、冯鹏靠、张永德、赵永贞、 刘青云、李强勇。 本标准制定过程中主要由彭敏、杨春玲、陈秀荔负贵文本起草、编制说明撰写、资料收集 等工作，由朱威霖、冯鹏靠、张永德、刘青云、李强勇负责资料收集、分析调研、试验论证等 工作，由曾地刚、赵永贞负责数据分析和文本修改等工作。 二、制定标准的必要性和意义 遗传多样性作为生物多样性的重要组成部分，是物种多样性、生态系统多样性和景观多 样性的基础。随着研究方法和实验技术的发展，遗传多样性研究从形态学水平、细胞学（染色 体）水平、生理生化水平逐渐发展到分子水平。 DNA 是遗传物质的载体，遗传信息就是DNA 的碱基排列顺序，因此直接对 DNA 碱基序列的分析和比较是揭示遗传多样性最理想的方法。 目前遗传多样性研究中常用的分子标记技术有微卫星和小卫星 DNA 标记、线粒体 DNA 标记、 核糖体 DNA 标记、随机扩增多态性 DNA (RAPD) 、限制性片段长度多态性 (RFLP) 、扩增 片段长度多态性 (AFLP) 、单链构象多态性 (SSCP) 、单核廿酸多态性 (SNP) 、表达序列标 签 (EST) 等。 线粒体 DNA (mitochondrial DNA, 简称 mtDNA)，呈闭合环装双链结构，包含 13 种蛋 白质多肤、 22 种 tRNA 的编码基因、 2 种 rRNA Cl2SrRNA, 16SrRNA) 、一个轻链复制起始区 (OL) 和 1 个主要非编码区 CD-loop) 。线粒体 DNA 可独立进行复制、转录和翻译，具有非 常活跃的自我复制能力。和核DNA 相比， mtDNA 具有分子量小、遵循母系遗传、进化速度 快、解码体系简单、编码效率高等特征，所以 mtDNA 标记在分子群体遗传学和分子系统学研 究方面得到广泛的应用。 本实验室基于线粒体DNA 序列的遗传多样性分析，经在鱼类、甲壳类、双壳类、多毛类 等水生动物不同地理群体中进行群体遗传学分析，可以准确反映水产动物群体遗传多样性，为 水生动物资源保护及开发利用提供了理论依据。这些研究为基于线粒体DNA 序列的水产动物 遗传多样性分析标准的问世奠定了基础，因此课题组制定本标准，从而更好规范使用线粒体 DNA 序列进行水产动物遗传多样性检测和分析。 本标准规定通过使用线粒体DNA 序列进行水产动物遗传多样性分析的技术规程，适用于 水产动物遗传多样性和群体结构分析。标准主要包括采样、 DNA 抽提、 PCR 扩增以及DNA 序列分析，序列分析主要包括核旮酸多样性、单倍型多样性分析、系统发生树的构建、遗传分 化指数分析、分子方差分析以及群体历史动态分析等。 目前尚无利用线粒体DNA 序列进行水产动物遗传多样性检测的国家标准，广西也无柜应 团体标准。 三、主要起草过程 （一）成立起草小组 广西壮族自治区水产科学研究院成立了《水产动物线粒体DNA 序列遗传多样性分析操作 规程》的标准起草工作小组；同时及时部署了制标工作方案和小组成员分工负贵制及标准起草 工作时间安排表，全面启动了该规程的编制工作。 （二）收集资料及调研 收集当前群体遗传多样性检测标准，分子标记技术的研究进展，以及线粒体DNA 序列开 发及应用进展等资料，并对当前研究人员、企业工作人员对分子标记的使用情况进行调研、分 析。目前，检索到的同类标准有：《畜禽微卫星 DNA 遗传多样性检测技术规程》 (NY/T 1673), 《畜禽线粒体 DNA 遗传多样性检测技术规程》(NY/T 1898) 。此外，标准起草组广泛收集 2015 年标准改革方案提出，尤其是 2019 年国家标准化管理委员会