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本发明公开了一种CRISPR目标区间变异检测的分析方法,1)将高质量测序数据使用flash软件将两条reads按照overlap进行合并,再使用cd_hit软件按照短序列与长序列完全相似的标准进行聚类,获得聚类结果;2)使用mafft软件将聚类结果与目标区间进行序列的多重比对,扫描目标区间,根据扫描结果查找出突变;3)根据步骤2)中找出的突变进行分类,再结合步骤1)中的聚类结果中每一个cluster的reads数除以总聚类的reads数,得到每个cluster条目对应分类的突变率;通过本发明的分
(19)中华人民共和国国家知识产权局
(12)发明专利申请
(10)申请公布号 CN 112687331 A
(43)申请公布日 2021.04.20
(21)申请号 202011596528.1
(22)申请日 2020.12.29
(71)申请人 上海派森诺生物科技股份有限公司
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