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本发明公开了一种抗生素耐药基因影响因素和差异性分析方法,包括如下步骤:输入样本宏基因组数据以及对应样本的表型信息;进行抗生素耐药基因注释,获得抗生素耐药基因丰度文件;抗生素耐药基因影响因素分析:PERMANOVA分析获得对抗生素耐药基因影响显著的表型;抗生素耐药基因差异性分析:利用Wilcoxon检验和FDR校正进行两组均值比较,利用Kruskal‑Wallis检验、PMCMR包中的多重比较和FDR校正进行两组以上均值比较;抗生素耐药基因含量变化趋势判断;本发明所用抗生素参考数据库更好地适应了抗
(19)中华人民共和国国家知识产权局
(12)发明专利申请
(10)申请公布号 CN 112802552 A
(43)申请公布日 2021.05.14
(21)申请号 202110035308.X
(22)申请日 2021.01.12
(71)申请人 大连理工大学
地址
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