基于转录因子的癌症早期筛查诊断方法.pdfVIP

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2023-06-12 发布于四川
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基于转录因子的癌症早期筛查诊断方法.pdf

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本发明涉及癌症筛查技术领域，尤其是指基于转录因子的癌症早期筛查诊断方法，包括以下步骤：S1，对样本进行测序获得下机数据进行拆分得到单个样本的测序数据，转换成FASTQ文件；S2，对FASTQ文件进行获得矫正的BAM文件；S3，从GTRD数据库中筛选得到可信转录因子，在每个转录因子结合位点计算上下游1000BP每个位置的深度，并取平均值；S4，上下游1000BP深度按照Savitzky‑Golay拆分成高频和低频信号，计算得TFscore；S5，筛选转录因子；S6，计算待测样本每个转录因子Zsco

(19)国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 115691665 A (43)申请公布日 2023.02.03 (21)申请号 202211717385.4 (22)申请日 2022.12.30 (71)申请人北京求臻医学检验实