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细菌HI-C基因组及质粒构象捕获方法.pdfVIP

细菌HI-C基因组及质粒构象捕获方法.pdf

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    本发明公开了细菌HI‑C基因组及质粒构象捕获方法，包括以下捕获步骤：细菌培养、交联反应、验证样品完整性、细菌裂解、消化染色质、生物素填补、连接反应、反向交联、文库提取、去除生物素、酚氯仿提取DNA、二代建库。通过甲醛处理将DNA与蛋白质交联在一起从而固定DNA的构象，并进行酶切、生物素引入、酶连和提取，然后对处理好的核酸进行文库构建和高通量测序，最终通过对测序数据进行分析即可揭示细菌染色质片段之间及其与质粒间的交互信息，可以应用于基因组组装、基因表达调控研究等。

    (19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 113215141 A (43)申请公布日 2021.08.06 (21)申请号 202110204762.3 (22)申请日 2021.02.23 (71)申请人 华南

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