生姜根系不同生态位细菌群落多样性特征、组成及结构差异.pdfVIP

第 ４３ 卷第 ４ 期 生 态 学 报 Ｖｏｌ．４３，Ｎｏ．４ ２０２３年２月 ＡＣＴＡ ＥＣＯＬＯＧＩＣＡ ＳＩＮＩＣＡ Ｆｅｂ．，２０２３ ＤＯＩ：１０．５８４６／ ｓｔｘｂ２０２２０３１５０６３２ 党柯柯，侯金凤，刘洪，董元华，李建刚．生姜根系不同生态位细菌群落多样性特征、组成及结构差异．生态学报，２０２３，４３（４）：１６９１⁃１７０２． Ｄａｎｇ Ｋ Ｋ，ＨｏｕＪＦ，ＬｉｕＨ，ＤｏｎｇＹＨ，ＬｉＪＧ．Ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓｏｆｂａｃｔｅｒｉａｌｃｏｍｍｕｎｉｔｙｄｉｖｅｒｓｉｔｙ，ｃｏｍｐｏｓｉｔｉｏｎａｎｄｓｔｒｕｃｔｕｒｅｉｎｄｉｆｆｅｒｅｎｔｎｉｃｈｅｓｏｆｇｉｎｇｅｒｒｏｏｔ． Ａｃｔａ Ｅｃｏｌｏｇｉｃａ Ｓｉｎｉｃａ，２０２３，４３（４）：１６９１⁃１７０２． 生姜根系不同生态位细菌群落多样性特征、组成及结 构差异 １，２ １，２ １，２ １，２ １，２，∗ 党柯柯 ，侯金凤 ，刘　 洪 ，董元华 ，李建刚 １ 中国科学院土壤科学研究所土壤环境与污染修复重点实验室，南京　 ２１０００８ ２ 中国科学院大学，北京　 １０００００ 摘要：生姜作为常见的调味品和传统中药材，是我国重要的经济作物之一。 作为取食部分的生姜块茎与根系直接相连，其产量、 品质与根相关细菌群落密切相关。 然而，关于生姜根系微环境中细菌群落的特点仍鲜有报道，土壤环境能否衍生出宿主特异性 内生菌群落尚不清楚。 以生姜根系不同生态位细菌群落为研究对象，采用高通量测序技术，对非根际、根际及根内细菌进行 １６ＳｒＲＮＡ基因测序。 结果表明，不同生态位细菌群落多样性存在显著差异，其中非根际及根际细菌群落多样性（Ｓｈａｎｎｏｎ ｉｎｄｅｘ，Ｏｂｓｅｒｖｅｄ ｓｐｅｃｉｅｓ，Ｆａｉｔｈ′ｓ ＰＤ）显著高于内生菌群落。 同时，各生态位共现网络稳定性和复杂度表现为非根际＞根际＞根内 ２ ＝ ＝ 细菌群落。 而在组成上，细菌群落在不同生态位差异显著（Ｒ ０．５７，Ｐ ０．００１）。 其中变形菌门（Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ）是根内的优势 门，该门类下假单胞菌属（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ）、短波单胞菌属（Ｂｒｅｖｕｎｄｉｍｏｎａｓ）、寡养单胞菌属（Ｓｔｅｎｏｔｒｏｐｈｏｍｏｎａｓ）及泛菌属（Ｐａｎｔｏｅａ） 在根内显著富集。 在根际细菌中，拟杆菌门（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｔｅｓ）及厚壁菌门（Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ）显著富集，其丰度优势主要由鞘氨醇菌属 （Ｃｈｉｔｉｎｏｐｈａｇａ）、杆菌属（Ｂａｃｉｌｌｕｓ）、金黄杆菌属（Ｃｈｒｙｓｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）等所贡献。 土壤环境因子对细菌群落有一定的影响，土壤ｐＨ 与非根际细菌群落密切相关，速效磷与根际细菌群落组成显著相关，而内生菌群落不受土壤理化因子的影响。 进一步通过溯源 分析发现根际细菌群落４２．８％源自非根际，而内生菌群落４７．３％源自根际，证明了生姜根相关细菌群落存在生态位水平传播。 总之，根系不同生态位的细菌群落多样性、稳定性及细菌分类均有显著差异，体现了根系对土壤细菌群落的筛选、过滤作用。 借 助于根系不同生态位细菌群落的组成分析，明确了不同生态位细菌的共性与差异，为生姜根系相关细菌群落的开发利用奠定了 基础。 关键词：生姜；细菌群落；根；生态位；溯源 Ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ ｏｆ ｂａｃｔｅｒｉａｌ ｃｏｍｍｕｎｉｔｙ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ， ｃｏｍｐｏｓｉｔｉｏｎ ａｎｄ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ｉｎ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ ｎｉｃｈｅｓ ｏｆ ｇｉｎｇｅｒ ｒｏｏｔ １，２ １，２ １，２ １，２ １，２，∗ ＤＡＮＧ Ｋｅｋｅ ，ＨＯＵＪｉｎｆｅｎｇ ，ＬＩＵ Ｈｏｎｇ ，ＤＯＮＧ Ｙｕａｎｈｕａ ，ＬＩ Ｊｉａｎｇａｎｇ １Ｋｅｙ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ ｏｆ Ｓｏｉｌ Ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔ ａｎｄ Ｐｏｌｌｕｔ