SF_T 0070-2020染色体遗传标记高通量测序与法医学应用规范.pdf

ICS07.140C 06SF中华人民共和国司法行政行业标准SF/T 0070—2020染色体遗传标记高通量测序与法医学应用规范Specification for high-throughput sequencing of chromosomal genetic markers andits forensic applications2020 - 05 - 29 发布2020-05-29 实施发布中华人民共和国司法部 SF/T 0070—2020目次前言II范围规范性引用文件23术语和定义缩略语45总体要求6检验程序5结果分析，78：结果应用8参考文献C SF/T 0070—2020前言本标准按照GB/T1.1一2009给出的规则起草。请注意本文件的某些内容可能涉及专利。本文件的发布机构不承担识别这些专利的责任。本标准由司法鉴定科学研究院提出。本标准由司法部信息中心归口。本标准起草单位：司法鉴定科学研究院、四川大学、中山大学、复旦大学、河北医科大学。本标准主要起草人：李成涛、张素华、侯一平、孙宏钰、谢建辉、李淑瑾。II SF/T 0070—2020染色体遗传标记高通量测序与法医学应用规范1范围本标准规定了染色体遗传标记高通量测序的总体要求、检验程序、结果分析和结果应用。本标准适用于人体血液（斑）、口腔拭子（唾液斑）、精液（斑）、带毛囊毛发、羊水和组织块等检材的染色体遗传标记高通量测序与法医学应用。12规范性引用文件下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件，仅注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件，其最新版本（包括所有的修改单）适用于本文件。GB/T6682分析实验室用水规格和试验方法GB/T27025检测和校准实验室能力的通用要求GB/T37223—2018亲权鉴定技术规范SF/ZJD0105011—2018法医学STR基因座命名规范SF/ZJD01050122018：个体识别技术规范33术语和定义下列术语和定义适用于本文件。3. 1基因座 locus基因在染色体上所占的位置。3. 2等位基因 allele位于同源染色体的相同位置上有差异的DNA片段互称为等位基因3. 3基因型 genotype个体在一个或者多个基因座上等位基因的组合。3. 4杂合子heterozygote二倍体中同源染色体同一位点上的两个等位基因不相同的基因型个体。1 SF/T 0070—20203. 5纯合子 homozygote二倍体中同源染色体同一位点上的两个等位基因相同的基因型个体3. 6微变异等位基因/中间等位基因microvariant allele/intermediate alleleSTR基因座上表现为含有不完整重复单位的等位基因。3. 7文库library通过生物来源、人工合成或克隆技术等获取的重建分子群。注：如基因组文库、互补DNA文库、噬菌体展示文库等。3. 8短串联重复序列 short tandem repeat，STR人类基因组中由2～6个碱基对作为核心单位，串联重复所形成的一类多态性遗传标记。3. 9单核苷酸多态性single nucleotidepolymorphism，SNP人类基因组中同一位置由单个核苷酸的变异所形成的一类多态性遗传标记。3. 10插入缺失多态性 insertion deletion polymorphism，InDel人类基因组中插入或缺失不同长度DNA片段所形成的一类多态性遗传标记。3. 11引物primer在DNA复制过程中，能与模板链互补并作为复制延伸的起始点、具有一定长度和碱基顺序的寡核苷酸链。3.12DNA聚合酶 DNA polymerase以DNA单链为模板，基于碱基互补配对原则，催化底物脱氧核糖核苷三磷酸分子生成双链DNA时所需要的酶。3.13聚合酶链反应 polymerase chain reaction，PCR模板DNA先经高温变性为两条单链，在适宜的温度下，成对的引物分别与两条模板DNA单链上的一段互补序列发生退火，随后在DNA聚合酶作用下，以四种dNTP（dATP、dGTP、dTTP、dCTP）为底物，催化磷酸二酯键形成，使引物得以延伸，如此反复变性、退火和延伸这一循环，使位于两段靶序列之间的DNA片段呈几何倍数扩增。2 SF/T 0070—20203.14乳液聚合酶链反应 emulsion polymerase chain reaction，ePCR乳化PCR按照一定的混合比例，将用于PCR反应的水相体系与油相体系混合，产生大量油包水的微乳液滴，每个微乳液滴形成独立PCR反应空间；如果PCR反应体系中加入的核酸模板数量合适，每个微乳液滴内将只含有一个模板分子；然后，每个微乳液滴进行平行扩增，即可同时得到大量模板分子的扩增产物。3.15桥式聚合酶链反应 b