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- 2023-08-23 发布于上海
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miRNA级联效应网络的建立与应用的中期报告
尊敬的评委和领导:
本中期报告是我在研究生课程期间进行的miRNA级联效应网络建立与应用的研究工作的进展汇报。
一、研究背景和意义
miRNA(MicroRNA)是一类长度约20-24个核苷酸的小分子ncRNA,它能够参与到细胞中一系列重要的生物学过程,例如基因表达调控、细胞分化、增殖以及凋亡等。在肿瘤的形成、发展过程中,miRNA也发挥着重要作用。据研究发现,许多肿瘤与miRNA表达水平的异常有关,因此,miRNA在肿瘤的研究方面受到了广泛的关注。
miRNA级联效应网络是通过对miRNA甚至其他的可调控因子的靶向基因及对多种生物学效应的细胞功能的探究而建立的一个复杂网络。这个网络不仅有助于我们理解miRNA参与肿瘤发生和发展的分子机制,也可以为临床诊断和治疗提供新的思路和方法。
二、研究进展
在本阶段的研究过程中,主要完成了以下几个方面的工作:
1. 数据预处理:从公开数据库(如miRTarBase、TargetScan、miRanda等)获取miRNA靶向基因的交互信息和相关的实验数据,并进行去重、筛选和统一数据格式等预处理工作。
2. 网络构建和可视化:根据预处理后的靶向基因及其功能信息,运用Cytoscape软件构建了miRNA级联效应网络,并对其进行了调整和美化,使得整个网络的结构和层次更加清晰和直观。
3. 生物信息学分析
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