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拟南芥蛋白精氨酸甲基转移酶AtPRMT5调节mRNA前体拼接的功能研究的中期报告
简介:
拟南芥(Arabidopsis thaliana)蛋白精氨酸甲基转移酶AtPRMT5是拟南芥基因组中5种蛋白精氨酸甲基转移酶之一,已知参与植物中多种生理过程的调控。本研究旨在探究AtPRMT5对mRNA前体的拼接调控作用及其机制。
研究内容:
1.构建AtPRMT5敲除拟南芥植株,通过RT-PCR和Northern blot检测AtPRMT5基因敲除后mRNA说明AtPRMT5对mRNA前体拼接有一定影响。
2.使用RNA-Seq对AtPRMT5敲除拟南芥植株和野生型拟南芥植株的转录组进行分析,发现AtPRMT5敲除影响了大量基因的表达,并且特别影响mRNA前体的拼接。
3.使用普通PCR和反转录PCR对不同拟南芥组织的mRNA前体和成熟mRNA进行检测,发现AtPRMT5调控的mRNA前体选择性剪接在不同组织中表现不同,证明该过程受到组织特异性和生物学意义的影响。
4.使用IP-MS检测AtPRMT5的交互蛋白,发现与AtPRMT5相互作用的蛋白包括调控RNA前体剪接的蛋白和其他多种转录因子。这些蛋白可能与AtPRMT5一起协同调控mRNA前体的拼接。
结论:
AtPRMT5对拟南芥mRNA前体拼接有明显调节作用,且该调节作用受到组织特异性和其他转录因子的影响。AtPRMT5可能参与RNA剪接复合物的组装,并协同调控mRNA前体拼接。
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